RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512291.5

EPN3-211, Transcript of epsin 3, humanhuman

TSL 2

Gene EPN3, Length 1,675 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPN3-211ENST00000512291 USP17L15C9J2P7 530 aa23.66■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.66■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 USP17L11C9JVI0 530 aa23.66■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 USP17L18D6R9N7 530 aa23.66■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 USP17L22D6RA61 530 aa23.66■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.66■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 USP17L19D6RCP7 530 aa23.66■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 USP17L20D6RJB6 530 aa23.66■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 GOLGA8HP0CJ92 632 aa23.66■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 RXRAP19793 462 aa23.66■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 PSMA5P28066 241 aa23.66■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 SLC1A4P43007 532 aa23.66■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 USP17L24Q0WX57 530 aa23.66■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 Q6ZUG5 572 aa23.66■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 IL17RAQ96F46 866 aa23.66■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 GMCL1Q96IK5 515 aa23.66■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 TM6SF1Q9BZW5 370 aa23.66■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa23.66■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 CENPFP49454 3210 aa23.66■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa23.66■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 WDR19Q8NEZ3 1342 aa23.65■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 ADGRA2Q96PE1 1338 aa23.65■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 CA12O43570 354 aa23.65■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 TTBK2Q6IQ55 1244 aa23.65■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 CPVLQ9H3G5 476 aa23.65■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.65■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 FLOT1O75955 427 aa23.64■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 ALDH1A1P00352 501 aa23.64■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 SNHG28P0DPA3 235 aa23.64■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 BMP3P12645 472 aa23.64■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 CCDC96Q2M329 555 aa23.64■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 GPCPD1Q9NPB8 672 aa23.64■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 CPA4Q9UI42 421 aa23.64■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa23.64■■□□□ 1.38
EPN3-211ENST00000512291 MYH6P13533 1939 aa23.64■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 HERVK_113P62684 666 aa23.64■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 TROAPQ12815 778 aa23.64■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 BRF1Q92994 677 aa23.64■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 MTA3Q9BTC8 594 aa23.64■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 BEGAINQ9BUH8 593 aa23.64■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 HTTP42858 3142 aa23.63■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 TMEM232C9JQI7 657 aa23.63■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 FOXN1O15353 648 aa23.63■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 OSBPP22059 807 aa23.63■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 SLC16A2P36021 539 aa23.63■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 LIFRP42702 1097 aa23.63■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP23.63■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 NFXL1Q6ZNB6 911 aa23.63■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 ZNF654Q8IZM8 581 aa23.63■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 STAG2Q8N3U4 1231 aa23.63■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 ATG4CQ96DT6 458 aa23.63■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.63■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 TXNRD2Q9NNW7 524 aa23.63■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 TLR2O60603 784 aa23.62■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 ZNF543Q08ER8 600 aa23.62■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 APOBRQ0VD83 1088 aa23.62■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa23.62■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 DCAF4Q8WV16 495 aa23.62■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa23.62■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 PNMA3Q9UL41 463 aa23.62■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 MGAMO43451 1857 aa23.62■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 DOCK3Q8IZD9 2030 aa23.61■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 CCDC69A6NI79 296 aa23.61■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 COG2Q14746 738 aa23.61■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 SGMS1Q86VZ5 419 aa23.61■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 NUP133Q8WUM0 1156 aa23.61■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 SAGE1Q9NXZ1 904 aa23.61■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 FGD1P98174 961 aa23.6■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 APOA5Q6Q788 366 aa23.6■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa23.6■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 KIFC2Q96AC6 838 aa23.6■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 CFHR5Q9BXR6 569 aa23.6■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 AGXT2Q9BYV1 514 aa23.6■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 PDRG1Q9NUG6 133 aa23.6■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 DSG3P32926 999 aa23.6■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 STAT2P52630 851 aa23.6■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 SNAP25P60880 206 aa23.6■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 CATIPQ7Z7H3 387 aa23.6■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 MICU3Q86XE3 530 aa23.6■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 PAGR1Q9BTK6 254 aa23.6■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 UBA5Q9GZZ9 404 aa23.6■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 BTBD7Q9P203 1132 aa23.6■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 RBPJLQ9UBG7 517 aa23.6■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 MAD2L2Q9UI95 211 aa23.6■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa23.6■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa23.59■■□□□ 1.37
EPN3-211ENST00000512291 CAP1Q01518 475 aa23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms