RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa12.55□□□□□ -0.4
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RABGEF1-208ENST00000510829 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-208ENST00000510829 PROM2Q8N271 834 aa12.55□□□□□ -0.4
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RABGEF1-208ENST00000510829 PODXL2Q9NZ53 605 aa12.55□□□□□ -0.4
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RABGEF1-208ENST00000510829 PDE6BP35913 854 aa12.54□□□□□ -0.4
RABGEF1-208ENST00000510829 TRAPPC10P48553 1259 aa12.54□□□□□ -0.4
RABGEF1-208ENST00000510829 PTPN14Q15678 1187 aa12.54□□□□□ -0.4
RABGEF1-208ENST00000510829 RASGRP2Q7LDG7 609 aa12.54□□□□□ -0.4
RABGEF1-208ENST00000510829 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
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RABGEF1-208ENST00000510829 NEDD1Q8NHV4 660 aa12.54□□□□□ -0.4
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RABGEF1-208ENST00000510829 TSC1Q92574 1164 aa12.54□□□□□ -0.4
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RABGEF1-208ENST00000510829 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
RABGEF1-208ENST00000510829 WWC2Q6AWC2 1192 aa12.54□□□□□ -0.4
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RABGEF1-208ENST00000510829 MYRIPQ8NFW9 859 aa12.54□□□□□ -0.4
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RABGEF1-208ENST00000510829 PAGE5Q96GU1 130 aa12.54□□□□□ -0.4
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RABGEF1-208ENST00000510829 DBNDD1Q9H9R9 158 aa12.54□□□□□ -0.4
RABGEF1-208ENST00000510829 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-208ENST00000510829 NT5C2P49902 561 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-208ENST00000510829 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-208ENST00000510829 NPY5RQ15761 445 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-208ENST00000510829 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
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RABGEF1-208ENST00000510829 C6orf50Q9HD87 102 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-208ENST00000510829 GPCPD1Q9NPB8 672 aa12.53□□□□□ -0.4
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RABGEF1-208ENST00000510829 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A087X0B3 334 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-208ENST00000510829 SMCO2A6NFE2 343 aa12.53□□□□□ -0.4
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RABGEF1-208ENST00000510829 SRGNP10124 158 aa12.53□□□□□ -0.4
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RABGEF1-208ENST00000510829 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-208ENST00000510829 SH3GLB2Q9NR46 395 aa12.53□□□□□ -0.4
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RABGEF1-208ENST00000510829 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa12.52□□□□□ -0.4
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RABGEF1-208ENST00000510829 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.4
RABGEF1-208ENST00000510829 CCDC96Q2M329 555 aa12.52□□□□□ -0.4
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RABGEF1-208ENST00000510829 TCP10Q12799 353 aa12.52□□□□□ -0.41
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RABGEF1-208ENST00000510829 CEP135Q66GS9 1140 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-208ENST00000510829 TYW1BQ6NUM6 668 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-208ENST00000510829 CCDC112Q8NEF3 446 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-208ENST00000510829 TEKT1Q969V4 418 aa12.52□□□□□ -0.41
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RABGEF1-208ENST00000510829 USP17L5A8MUK1 530 aa12.51□□□□□ -0.41
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RABGEF1-208ENST00000510829 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-208ENST00000510829 GOLGA8FQ08AF8 430 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-208ENST00000510829 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-208ENST00000510829 FLAD1Q8NFF5 587 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-208ENST00000510829 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-208ENST00000510829 MASTLQ96GX5 879 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-208ENST00000510829 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-208ENST00000510829 SERPINB13Q9UIV8 391 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-208ENST00000510829 PES1O00541 588 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
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