RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510195.1

SNF8-208, Transcript of SNF8, ESCRT-II complex subunit, human

TSL 2

Gene SNF8, Length 445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNF8-208	ENST00000510195	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SNF8-208	ENST00000510195	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
SNF8-208	ENST00000510195	PLS1	Q14651	629 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SNF8-208	ENST00000510195	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
SNF8-208	ENST00000510195	CRBN	Q96SW2	442 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SNF8-208	ENST00000510195	PARP14	Q460N5	1801 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SNF8-208	ENST00000510195	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	31.82	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	COL6A1	P12109	1028 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	COPB2	P35606	906 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	ALPK3	Q96L96	1907 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195		A0A1W2PPC1	479 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	VWA5A	O00534	786 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	FCER1A	P12319	257 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	TICAM2	Q86XR7	235 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	MKL1	Q969V6	931 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	STAP2	Q9UGK3	403 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	CYP2C19	P33261	490 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	PDE4B	Q07343	736 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	PFAS	O15067	1338 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195		F5H6K3	240 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	RAD21	O60216	631 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	COBL	O75128	1261 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	KLRC3	Q07444	240 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	NAPB	Q9H115	298 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SNF8-208	ENST00000510195	CYBA	P13498	195 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	STAT3	P40763	770 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	EVI5L	Q96CN4	794 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	CNGA1	P29973	690 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	REPS2	Q8NFH8	660 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	PRDM1	O75626	825 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	TTLL1	O95922	423 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	NDUFB10	O96000	172 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	PPARA	Q07869	468 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	TRPV1	Q8NER1	839 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	MAML3	Q96JK9	1138 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	TSPY3	P0CV98	308 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	TSPY8	P0CW00	308 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	PDE1A	P54750	535 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	KCTD2	Q14681	263 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	CEP95	Q96GE4	821 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	MMP19	Q99542	508 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	SEPT4	O43236	478 aa		31.71	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	BMP8B	P34820	402 aa		31.71	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		31.71	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		31.71	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	SZT2	Q5T011	3432 aa		31.71	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	MYH4	Q9Y623	1939 aa		31.71	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	DNM1L	O00429	736 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	ATP2A1	O14983	1001 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	GDF15	Q99988	308 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SNF8-208	ENST00000510195	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	31.69	■■■□□ 2.66
SNF8-208	ENST00000510195	FEM1B	Q9UK73	627 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SNF8-208	ENST00000510195	ZBED4	O75132	1171 aa		31.67	■■■□□ 2.66
SNF8-208	ENST00000510195	TFAP4	Q01664	338 aa		31.67	■■■□□ 2.66
SNF8-208	ENST00000510195	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		31.67	■■■□□ 2.66
SNF8-208	ENST00000510195	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	31.67	■■■□□ 2.66
SNF8-208	ENST00000510195	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	31.67	■■■□□ 2.66
SNF8-208	ENST00000510195	FOXP2	O15409	715 aa		31.66	■■■□□ 2.66
SNF8-208	ENST00000510195	FDX1	P10109	184 aa		31.66	■■■□□ 2.66
SNF8-208	ENST00000510195	ALX1	Q15699	326 aa		31.66	■■■□□ 2.66
SNF8-208	ENST00000510195	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		31.66	■■■□□ 2.66
SNF8-208	ENST00000510195	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	31.66	■■■□□ 2.66
SNF8-208	ENST00000510195	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	31.66	■■■□□ 2.66
SNF8-208	ENST00000510195	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		31.66	■■■□□ 2.66
SNF8-208	ENST00000510195	LAMA3	Q16787	3333 aa		31.65	■■■□□ 2.66
SNF8-208	ENST00000510195	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	31.65	■■■□□ 2.66
SNF8-208	ENST00000510195	SMC5	Q8IY18	1101 aa		31.65	■■■□□ 2.66

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms