RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 ERC2O15083 957 aa6.69□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 CIAO1O76071 339 aa6.69□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 MMP10P09238 476 aa6.69□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 POLD1P28340 1107 aa6.69□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 MRE11P49959 708 aa6.69□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATP1A2P50993 1020 aa6.69□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 RPS8P62241 208 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 METTL24Q5JXM2 366 aa6.69□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 MSL1Q68DK7 614 aa6.69□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRR5LQ6MZQ0 368 aa6.69□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.69□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 BTLAQ7Z6A9 289 aa6.69□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 LARGE2Q8N3Y3 721 aa6.69□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 KLHDC4Q8TBB5 520 aa6.69□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 BRIP1Q9BX63 1249 aa6.69□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa6.69□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC6A14Q9UN76 642 aa6.69□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A0A0MRY4 1105 aa6.68□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.68□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 H0YIN7 160 aa6.68□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 ALDH1B1P30837 517 aa6.68□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 PDE1AP54750 535 aa6.68□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 NUCB2P80303 420 aa6.68□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa6.68□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 TFCP2Q12800 502 aa6.68□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 MBTPS1Q14703 1052 aa6.68□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.68□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 NUDT8Q8WV74 236 aa6.68□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 MROH5Q6ZUA9 1318 aa6.68□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 SCN7AQ01118 1682 aa6.68□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 C4AP0C0L4 1744 aa6.67□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 BBOX1O75936 387 aa6.67□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 SASH1O94885 1247 aa6.67□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 MX1P20591 662 aa6.67□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 MCCP23508 829 aa6.67□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 KCNJ4P48050 445 aa6.67□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 PLAURQ03405 335 aa6.67□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADGRE1Q14246 886 aa6.67□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 LRRC24Q50LG9 513 aa6.67□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC158Q5M9N0 1113 aa6.67□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 CLEC17AQ6ZS10 378 aa6.67□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 AACSQ86V21 672 aa6.67□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 GSX2Q9BZM3 304 aa6.67□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANKRD2Q9GZV1 360 aa6.67□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 GRPEL1Q9HAV7 217 aa6.67□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 GPR108Q9NPR9 543 aa6.67□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 SEC31BQ9NQW1 1179 aa6.67□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 AOX1Q06278 1338 aa6.67□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 SALL3Q9BXA9 1300 aa6.67□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 LILRB5O75023 590 aa6.66□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 PDE8BO95263 885 aa6.66□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 BAG4O95429 457 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC5A1P13866 664 aa6.66□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 NPR1P16066 1061 aa6.66□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 TIMM10P62072 90 aa6.66□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 DDR1Q08345 913 aa6.66□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 GRAPQ13588 217 aa6.66□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 TNNI3KQ59H18 835 aa6.66□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATG9AQ7Z3C6 839 aa6.66□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMC4Q7Z404 712 aa6.66□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 MASTLQ96GX5 879 aa6.66□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 MTFR1LQ9H019 292 aa6.66□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGFLR1Q9H665 355 aa6.66□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 ECHDC1Q9NTX5 307 aa6.66□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa6.66□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 STAP2Q9UGK3 403 aa6.66□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa6.66□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa6.66□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 TTC41PQ6P2S7 1318 aa6.66□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 RTL9Q8NET4 1388 aa6.66□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 QSER1Q2KHR3 1735 aa6.65□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A1B0GUL7 405 aa6.65□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZBTB7AO95365 584 aa6.65□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 MCM2P49736 904 aa6.65□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATP2B3Q16720 1220 aa6.65□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 CAVIN4Q5BKX8 364 aa6.65□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 TTC39AQ5SRH9 613 aa6.65□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 VPS37DQ86XT2 251 aa6.65□□□□□ -1.34
ARHGEF3-215ENST00000498517 C2CD5Q86YS7 1000 aa6.65□□□□□ -1.34
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