RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496101.5

GCOM1-211, Transcript of GRINL1A complex locus 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GCOM1, Length 2,032 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCOM1-211ENST00000496101 SOWAHDA6NJG2 315 aa20.62■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 SEMA3FQ13275 785 aa20.62■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 CTNND2Q9UQB3 1225 aa20.62■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 CASP1P29466 404 aa20.61■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa20.61■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 BARGINQ6ZT62 677 aa20.61■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa20.61■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 ANKS1AQ92625 1134 aa20.61■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 GOLGA1Q92805 767 aa20.61■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.61■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.61■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.61■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 MTF1Q14872 753 aa20.61■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa20.61■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 NYXQ9GZU5 481 aa20.61■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 GYPCP04921 128 aa20.6■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 TXLNAP40222 546 aa20.6■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 TUBB4BP68371 445 aa20.6■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 PAK1Q13153 545 aa20.6■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 KARSQ15046 597 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 TMTC1Q8IUR5 882 aa20.6■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 KIF5CO60282 957 aa20.6■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 PLA2G4AP47712 749 aa20.6■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 RPS8P62241 208 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 KRT31Q15323 416 aa20.6■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 IL17AQ16552 155 aa20.6■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 CCDC178Q5BJE1 867 aa20.6■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.6■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 RCSD1Q6JBY9 416 aa20.6■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 DGKHQ86XP1 1220 aa20.6■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.6■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.59■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 BLIDQ8IZY5 108 aa20.59■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 TSPY2A6NKD2 308 aa20.58■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 NMT2O60551 498 aa20.58■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 CASP14P31944 242 aa20.58■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 GNAQP50148 359 aa20.58■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 COPB1P53618 953 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 FAM47AQ5JRC9 791 aa20.58■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 DAGLBQ8NCG7 672 aa20.58■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 LINC00116Q8NCU8 138 aa20.58■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 MTRQ99707 1265 aa20.58■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 PCDHA4Q9UN74 947 aa20.58■□□□□ 0.89
GCOM1-211ENST00000496101 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 MYL1P05976 194 aa20.58■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 MCM7P33993 719 aa20.58■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 TAF3Q5VWG9 929 aa20.58■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 GALNT17Q6IS24 598 aa20.58■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 UBXN6Q9BZV1 441 aa20.58■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 N4BP3O15049 544 aa20.57■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 KLRK1P26718 216 aa20.57■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 TCP11X2Q5H9J9 407 aa20.57■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 TEX35Q5T0J7 233 aa20.57■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.57■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 CEP112Q8N8E3 955 aa20.57■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.57■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 KAT14Q9H8E8 782 aa20.57■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 MYO1AQ9UBC5 1043 aa20.57■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 CYP2D6P10635 497 aa20.56■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 GRM4Q14833 912 aa20.56■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 NELFBQ8WX92 580 aa20.56■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 ABHD10Q9NUJ1 306 aa20.56■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 CDC23Q9UJX2 597 aa20.56■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 KCNJ18B7U540 433 aa20.56■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 POTEB2H3BUK9 544 aa20.56■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 H7C1D1 291 aa20.56■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 M0R2N6 131 aa20.56■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 EVX2Q03828 476 aa20.56■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 KCNJ12Q14500 433 aa20.56■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 KCNB1Q14721 858 aa20.56■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 CPLX3Q8WVH0 158 aa20.56■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 STAMQ92783 540 aa20.56■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 NLRP3Q96P20 1036 aa20.56■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 LZTFL1Q9NQ48 299 aa20.56■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 IRS2Q9Y4H2 1338 aa20.56■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 NAV1Q8NEY1 1877 aa20.56■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 MYH8P13535 1937 aa20.56■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 PRDX5P30044 214 aa20.55■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 BRD3Q15059 726 aa20.55■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 TBC1D9BQ66K14 1250 aa20.55■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 CYP26C1Q6V0L0 522 aa20.55■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 SBF2Q86WG5 1849 aa20.55■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 CCDC148Q8NFR7 591 aa20.55■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 DISC1Q9NRI5 854 aa20.55■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa20.55■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 CCDC151A5D8V7 595 aa20.54■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 LAD1O00515 517 aa20.54■□□□□ 0.88
GCOM1-211ENST00000496101 TBC1D8O95759 1140 aa20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms