RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, human

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SIMC1-208	ENST00000495423	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	VCPKMT	Q9H867	229 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	PHF24	Q9UPV7	400 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	SLC25A27	O95847	323 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	FCER1A	P12319	257 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	ICA1	Q05084	483 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	AKR1B1	P15121	316 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	FERMT2	Q96AC1	680 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	GOLIM4	O00461	696 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	TLE2	Q04725	743 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	CCDC17	Q96LX7	622 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	RARB	P10826	455 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	ARMT1	Q9H993	441 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
SIMC1-208	ENST00000495423	MCM3AP	O60318	1980 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	MMP19	Q99542	508 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	TINF2	Q9BSI4	451 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	CLTB	P09497	229 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	ITGB8	P26012	769 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	C12orf60	Q5U649	245 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	RNF180	Q86T96	592 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	MYLIP	Q8WY64	445 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	MYO9B	Q13459	2157 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	MYH4	Q9Y623	1939 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	KIAA0355	O15063	1070 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	PRKAB2	O43741	272 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	ADD2	P35612	726 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	CDK8	P49336	464 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	MBD4	O95243	580 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	PGK2	P07205	417 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	KCTD2	Q14681	263 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	SMIM22	K7EJ46	135 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	VWA5A	O00534	786 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	PGK1	P00558	417 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	COPB2	P35606	906 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	STAT3	P40763	770 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423		A0A1W2PQY0	241 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	AKR1A1	P14550	325 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	EPHB4	P54760	987 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	REPS2	Q8NFH8	660 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
SIMC1-208	ENST00000495423	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	ADAMTS4	O75173	837 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	RAG1	P15918	1043 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	GOPC	Q9HD26	462 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	USP17L12	C9JPN9	530 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	USP17L21	D6R901	530 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	HMMR	O75330	724 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	FOSL2	P15408	326 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	TOX2	Q96NM4	488 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	CRBN	Q96SW2	442 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	27.74	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	APBB1	O00213	710 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	ATP5J	P18859	108 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	FPGS	Q05932	587 aa		27.73	■■■□□ 2.03

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