RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CYP7A1P22680 504 aa7.67□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MCM4P33991 863 aa7.67□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ETV3P41162 512 aa7.67□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CTSWP56202 376 aa7.67□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PAK2Q13177 524 aa7.67□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GAB4Q2WGN9 574 aa7.67□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARSHQ5FYA8 562 aa7.67□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COX4I2Q96KJ9 171 aa7.67□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC74BQ96LY2 380 aa7.67□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 Q96M66 194 aa7.67□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC26A8Q96RN1 970 aa7.67□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIF2CQ99661 725 aa7.67□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNF32Q9H0A6 362 aa7.67□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANTXR1Q9H6X2 564 aa7.67□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RGS13O14921 159 aa7.66□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIR3DL1P43629 444 aa7.66□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HK2P52789 917 aa7.66□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MLECQ14165 292 aa7.66□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDCP2Q5VXM1 449 aa7.66□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OVOS1Q6IE37 1185 aa7.66□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa7.66□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATG4CQ96DT6 458 aa7.66□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CNNM2Q9H8M5 875 aa7.66□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa7.65□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAC2P15153 192 aa7.65□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RBM25P49756 843 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TIGD5Q53EQ6 642 aa7.65□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNN1Q92952 543 aa7.65□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VWCEQ96DN2 955 aa7.65□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MCOLN1Q9GZU1 580 aa7.65□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNRF3Q9ULT6 936 aa7.65□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 JAG2Q9Y219 1238 aa7.65□□□□□ -1.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MEIS3P2A8K0S8 358 aa7.64□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NUAK1O60285 661 aa7.64□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBOX5O94941 541 aa7.64□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PHACTR4Q8IZ21 702 aa7.64□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RASGRP4Q8TDF6 673 aa7.64□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TGIF2Q9GZN2 237 aa7.64□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GJA8P48165 433 aa7.63□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNF141Q8WVD5 230 aa7.63□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KREMEN1Q96MU8 473 aa7.63□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa7.63□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACBD3Q9H3P7 528 aa7.63□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C19orf44Q9H6X5 657 aa7.63□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GINM1Q9NU53 330 aa7.63□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRN2O75325 713 aa7.62□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZGLP1P0C6A0 271 aa7.62□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NME1P15531 152 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAG1P15918 1043 aa7.62□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TCF3P15923 654 aa7.62□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TNNI2P48788 182 aa7.62□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.62□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPRASP2Q96D09 838 aa7.62□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GCM1Q9NP62 436 aa7.62□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPT2Q9UMR5 302 aa7.62□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TNFRSF10CO14798 259 aa7.61□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GBP1P32455 592 aa7.61□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SOX9P48436 509 aa7.61□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CREG2Q8IUH2 290 aa7.61□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DTWD2Q8NBA8 298 aa7.61□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PARD6AQ9NPB6 346 aa7.61□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGSF5Q9NSI5 407 aa7.61□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IMPDH2P12268 514 aa7.6□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP10-2P60368 255 aa7.6□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DLG4P78352 724 aa7.6□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPATA32Q96LK8 384 aa7.6□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNC2Q96PR1 638 aa7.6□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC9A7Q96T83 725 aa7.6□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ASPNQ9BXN1 380 aa7.6□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EBF1Q9UH73 591 aa7.6□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EFR3BQ9Y2G0 817 aa7.6□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACRP10323 421 aa7.59□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCNFP41002 786 aa7.59□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IRF2BP1Q8IU81 584 aa7.59□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDZD8Q8NEN9 1154 aa7.59□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FERD3LQ96RJ6 166 aa7.59□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPR62Q9BZJ7 368 aa7.59□□□□□ -1.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADAMTS20P59510 1910 aa7.58□□□□□ -1.2
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM192Q8IY95 271 aa7.58□□□□□ -1.2
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RELTQ969Z4 430 aa7.58□□□□□ -1.2
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP7.58□□□□□ -1.2
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCSER2Q9H7U1 834 aa7.58□□□□□ -1.2
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNH3Q9ULD8 1083 aa7.58□□□□□ -1.2
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PEX10O60683 326 aa7.57□□□□□ -1.2
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NR0B2Q15466 257 aa7.57□□□□□ -1.2
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SHISA4Q96DD7 197 aa7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms