RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 TFF2Q03403 129 aa7.5□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 ALDH1L2Q3SY69 923 aa7.5□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 ZNF365Q70YC5 407 aa7.5□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 HERVK_113Q902F9 699 aa7.5□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 TINF2Q9BSI4 451 aa7.5□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa7.5□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 SH2D4AQ9H788 454 aa7.5□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 TBX21Q9UL17 535 aa7.5□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 ELP1O95163 1332 aa7.5□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa7.49□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 E9PSI1 815 aa7.49□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 IDH1O75874 414 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 FGBP02675 491 aa7.49□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 BMP1P13497 986 aa7.49□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 COPB2P35606 906 aa7.49□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 KCNQ1P51787 676 aa7.49□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 SEPT2Q15019 361 aa7.49□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 KCNA10Q16322 511 aa7.49□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 RASIP1Q5U651 963 aa7.49□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 ADGRA1Q86SQ6 560 aa7.49□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 MIGA1Q8NAN2 632 aa7.49□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 ATG4CQ96DT6 458 aa7.49□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 MEIS3Q99687 375 aa7.49□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 EPHX3Q9H6B9 360 aa7.49□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa7.49□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 IL23AQ9NPF7 189 aa7.49□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 FAM184BQ9ULE4 1060 aa7.49□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa7.49□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 SMCHD1A6NHR9 2005 aa7.49□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 CHD9Q3L8U1 2897 aa7.49□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 FOCADQ5VW36 1801 aa7.48□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 ZBBXA8MT70 800 aa7.48□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 ERC2O15083 957 aa7.48□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 ANP32CO43423 234 aa7.48□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 ADAMTS4O75173 837 aa7.48□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 PGK2P07205 417 aa7.48□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 DSG3P32926 999 aa7.48□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 SHMT1P34896 483 aa7.48□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 TMEM179Q6ZVK1 233 aa7.48□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 OTOP2Q7RTS6 562 aa7.48□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 FAM9BQ8IZU0 186 aa7.48□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 SPICE1Q8N0Z3 855 aa7.48□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 CDCA7LQ96GN5 454 aa7.48□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 HIPK3Q9H422 1215 aa7.48□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 COG5Q9UP83 839 aa7.48□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa7.48□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 CHD7Q9P2D1 2997 aa7.48□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 MYH1P12882 1939 aa7.47□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 FAM86C2PA6NEL3 165 aa7.47□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 ARVCFO00192 962 aa7.47□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 WDR46O15213 610 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 GPR37L1O60883 481 aa7.47□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 CST5P28325 142 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 CYP2C18P33260 490 aa7.47□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 GUCY1A2P33402 732 aa7.47□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 ZAP70P43403 619 aa7.47□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 ICA1Q05084 483 aa7.47□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 MTX1Q13505 466 aa7.47□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 TMEM132BQ14DG7 1078 aa7.47□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 C16orf59Q7L2K0 433 aa7.47□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 RIOX2Q8IUF8 465 aa7.47□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 MAGEB6Q8N7X4 407 aa7.47□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 DDX11Q96FC9 970 aa7.47□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa7.47□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa7.47□□□□□ -1.21
CBX1-205ENST00000495350 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 A0A1W2PRG0 241 aa7.46□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 RAD21O60216 631 aa7.46□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 ASGR1P07306 291 aa7.46□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 STAT3P40763 770 aa7.46□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 CDK7P50613 346 aa7.46□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 PLCD1P51178 756 aa7.46□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 RABGGTBP53611 331 aa7.46□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 ZNF792Q3KQV3 632 aa7.46□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 TNNI3KQ59H18 835 aa7.46□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 TMEM67Q5HYA8 995 aa7.46□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 GNASQ5JWF2 1037 aa7.46□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms