RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492601.2

SGMS1-204, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 625 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-204ENST00000492601 CYP2C19P33261 490 aa20.63■□□□□ 0.89
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SGMS1-204ENST00000492601 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20.63■□□□□ 0.89
SGMS1-204ENST00000492601 C7orf61Q8IZ16 206 aa20.63■□□□□ 0.89
SGMS1-204ENST00000492601 SHCBP1Q8NEM2 672 aa20.63■□□□□ 0.89
SGMS1-204ENST00000492601 STRNO43815 780 aa20.62■□□□□ 0.89
SGMS1-204ENST00000492601 PRDM1O75626 825 aa20.62■□□□□ 0.89
SGMS1-204ENST00000492601 CNGA1P29973 690 aa20.62■□□□□ 0.89
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SGMS1-204ENST00000492601 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.62■□□□□ 0.89
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SGMS1-204ENST00000492601 MROH8Q9H579 483 aa20.61■□□□□ 0.89
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SGMS1-204ENST00000492601 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa20.6■□□□□ 0.89
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SGMS1-204ENST00000492601 PRO3102Q9H379 93 aa20.59■□□□□ 0.89
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SGMS1-204ENST00000492601 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa20.58■□□□□ 0.89
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SGMS1-204ENST00000492601 VWA5AO00534 786 aa20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-204ENST00000492601 SLC25A27O95847 323 aa20.57■□□□□ 0.88
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SGMS1-204ENST00000492601 RIOX2Q8IUF8 465 aa20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-204ENST00000492601 ABRAQ8N0Z2 381 aa20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-204ENST00000492601 CEP95Q96GE4 821 aa20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-204ENST00000492601 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-204ENST00000492601 NDUFB10O96000 172 aa20.56■□□□□ 0.88
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SGMS1-204ENST00000492601 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa20.55■□□□□ 0.88
SGMS1-204ENST00000492601 ANO1Q5XXA6 986 aa20.55■□□□□ 0.88
SGMS1-204ENST00000492601 REPS2Q8NFH8 660 aa20.55■□□□□ 0.88
SGMS1-204ENST00000492601 MAML3Q96JK9 1138 aa20.55■□□□□ 0.88
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SGMS1-204ENST00000492601 PDE1AP54750 535 aa20.54■□□□□ 0.88
SGMS1-204ENST00000492601 LRRC26Q2I0M4 334 aa20.54■□□□□ 0.88
SGMS1-204ENST00000492601 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
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SGMS1-204ENST00000492601 SEPT4O43236 478 aa20.51■□□□□ 0.87
SGMS1-204ENST00000492601 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SGMS1-204ENST00000492601 VPS53Q5VIR6 699 aa20.51■□□□□ 0.87
SGMS1-204ENST00000492601 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.51■□□□□ 0.87
SGMS1-204ENST00000492601 CPXCR1Q8N123 301 aa20.51■□□□□ 0.87
SGMS1-204ENST00000492601 KIFC2Q96AC6 838 aa20.51■□□□□ 0.87
SGMS1-204ENST00000492601 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.51■□□□□ 0.87
SGMS1-204ENST00000492601 GDF15Q99988 308 aa20.51■□□□□ 0.87
SGMS1-204ENST00000492601 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.51■□□□□ 0.87
SGMS1-204ENST00000492601 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
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