RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486420.1

C9orf16-202, Transcript of chromosome 9 open reading frame 16, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf16, Length 434 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16-202ENST00000486420 NEDD4P46934 1319 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf16-202ENST00000486420 TNKSO95271 1327 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf16-202ENST00000486420 FLOT1O75955 427 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf16-202ENST00000486420 BMP3P12645 472 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf16-202ENST00000486420 MAPK4P31152 587 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf16-202ENST00000486420 HSPA4P34932 840 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf16-202ENST00000486420 STAT2P52630 851 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf16-202ENST00000486420 OAZ1P54368 228 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf16-202ENST00000486420 FCGRTP55899 365 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf16-202ENST00000486420 ANAPC15P60006 121 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf16-202ENST00000486420 SKAP1Q86WV1 359 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf16-202ENST00000486420 IL17RBQ9NRM6 502 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf16-202ENST00000486420 ADGRA2Q96PE1 1338 aa14.52□□□□□ -0.08
C9orf16-202ENST00000486420 SMIM22K7EJ46 135 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 ZBED4O75132 1171 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 SLC25A27O95847 323 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 NDUFB10O96000 172 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 CALM1P0DP23 149 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 CALM2P0DP24 149 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 CALM3P0DP25 149 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 CYP2C8P10632 490 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 BCRP11274 1271 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 DSG3P32926 999 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 LIFRP42702 1097 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 WTAPQ15007 396 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 ASPRV1Q53RT3 343 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 KCNB2Q92953 911 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 COA7Q96BR5 231 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 NEK1Q96PY6 1258 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 MAP3K14Q99558 947 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 SLF1Q9BQI6 1058 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 MAF1Q9H063 256 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 CATIPQ7Z7H3 387 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 PNMA1Q8ND90 353 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 SHCBP1Q8NEM2 672 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 EFCC1Q9HA90 598 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 HTTP42858 3142 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 ATP2A1O14983 1001 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 STRNO43815 780 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 KIF5BP33176 963 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 ERVK-9P63128 1117 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 ERVK-24P63145 666 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 PPP2R5BQ15173 497 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 TMEM67Q5HYA8 995 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 FAM83BQ5T0W9 1011 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 MROH8Q9H579 483 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 SLC5A4Q9NY91 659 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 HPS5Q9UPZ3 1129 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 CCDC69A6NI79 296 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 PRC1O43663 620 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 SNHG28P0DPA3 235 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 RGS19P49795 217 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 GNAQP50148 359 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 RCAN1P53805 252 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 FGD1P98174 961 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 CCDC96Q2M329 555 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 CLEC10AQ8IUN9 316 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 SOCS4Q8WXH5 440 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 LZTS2Q9BRK4 669 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 USP26Q9BXU7 913 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 INCENPQ9NQS7 918 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 FBXO40Q9UH90 709 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 CPA4Q9UI42 421 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 MYH4Q9Y623 1939 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 NMT2O60551 498 aa14.48□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 DDAH1O94760 285 aa14.48□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 CAPN2P17655 700 aa14.48□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 PSMC4P43686 418 aa14.48□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 SEC23AQ15436 765 aa14.48□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 TKFCQ3LXA3 575 aa14.48□□□□□ -0.09
C9orf16-202ENST00000486420 BTNL9Q6UXG8 535 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms