RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486028.1

HMG20B-211, Transcript of high mobility group 20B, humanhuman

TSL 2

Gene HMG20B, Length 719 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20B-211ENST00000486028 MB21D1Q8N884 522 aa14.69□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 KRT23Q9C075 422 aa14.69□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 CNNM2Q9H8M5 875 aa14.69□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 MYPNQ86TC9 1320 aa14.68□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 CDC45O75419 566 aa14.68□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 MAPK4P31152 587 aa14.68□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 NOVP48745 357 aa14.68□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 Q3C1V9 767 aa14.68□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.68□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 SLFN13Q68D06 897 aa14.68□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 POTEEQ6S8J3 1075 aa14.68□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 RAET1EQ8TD07 263 aa14.68□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 MAP4K1Q92918 833 aa14.68□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 TTC14Q96N46 770 aa14.68□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa14.68□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa14.68□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 PEX10O60683 326 aa14.67□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 CAPN15O75808 1086 aa14.67□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 CNMDO75829 334 aa14.67□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 TRDNQ13061 729 aa14.67□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 NBPF11Q86T75 865 aa14.67□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 IQCA1Q86XH1 822 aa14.67□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.67□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 GMCL1Q96IK5 515 aa14.67□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 FBXO28Q9NVF7 368 aa14.67□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 BTBD7Q9P203 1132 aa14.67□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 FEM1BQ9UK73 627 aa14.67□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 NEDD4P46934 1319 aa14.66□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 B4E1Z4 1266 aa14.66□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 KDM4AO75164 1064 aa14.66□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 BMP3P12645 472 aa14.66□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 SLC1A4P43007 532 aa14.66□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 PRKCZQ05513 592 aa14.66□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.66□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 ATG4CQ96DT6 458 aa14.66□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 SLF1Q9BQI6 1058 aa14.66□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 ZSWIM5Q9P217 1185 aa14.66□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.66□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 GABRQQ9UN88 632 aa14.66□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa14.66□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 CYP21A2P08686 494 aa14.65□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 MCCP23508 829 aa14.65□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 FLT3LGP49771 235 aa14.65□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 IRF5Q13568 498 aa14.65□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 PLEKHH3Q7Z736 793 aa14.65□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 DGKHQ86XP1 1220 aa14.65□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 CHURC1Q8WUH1 139 aa14.65□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 ARMC5Q96C12 935 aa14.65□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.65□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 PORCNQ9H237 461 aa14.65□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 ANO2Q9NQ90 1003 aa14.65□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 VWA5AO00534 786 aa14.64□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 PLS1Q14651 629 aa14.64□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 WDR78Q5VTH9 848 aa14.64□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 RCSD1Q6JBY9 416 aa14.64□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 NKX2-3Q8TAU0 364 aa14.64□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 DCAF4Q8WV16 495 aa14.64□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa14.64□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 UBAC1Q9BSL1 405 aa14.64□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 SPATC1LQ9H0A9 340 aa14.64□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 GJD2Q9UKL4 321 aa14.64□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 TMEM232C9JQI7 657 aa14.63□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 ADCY3O60266 1144 aa14.63□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 ZBED4O75132 1171 aa14.63□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 GRK4P32298 578 aa14.63□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 TMEM132BQ14DG7 1078 aa14.63□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 GPR142Q7Z601 462 aa14.63□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 FAM160B2Q86V87 743 aa14.63□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 SLAIN1Q8ND83 568 aa14.63□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 SHCBP1Q8NEM2 672 aa14.63□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 SOCS4Q8WXH5 440 aa14.63□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 ANKS1AQ92625 1134 aa14.63□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 KIFC2Q96AC6 838 aa14.63□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.63□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 NUDT12Q9BQG2 462 aa14.63□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 MROH8Q9H579 483 aa14.63□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 MTMR7Q9Y216 660 aa14.63□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa14.63□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 MYH4Q9Y623 1939 aa14.62□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 E7EWF7 191 aa14.62□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 PLA2G6O60733 806 aa14.62□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 SLC25A27O95847 323 aa14.62□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 FDX1P10109 184 aa14.62□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 STAT3P40763 770 aa14.62□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 STAT2P52630 851 aa14.62□□□□□ -0.07
HMG20B-211ENST00000486028 CCDC96Q2M329 555 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms