RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 DNM1LO00429 736 aa20.3■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 STK11IPQ8N1F8 1099 aa20.3■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 OSBP2Q969R2 916 aa20.3■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 DCTPP1Q9H773 170 aa20.3■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.3■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 GSG1L2A8MUP6 293 aa20.29■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 RAD21O60216 631 aa20.29■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.29■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 ANO1Q5XXA6 986 aa20.29■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 TDHQ8IZJ6 230 aa20.29■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 ABRAQ8N0Z2 381 aa20.29■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 GPATCH3Q96I76 525 aa20.29■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 MAML3Q96JK9 1138 aa20.29■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 GOPCQ9HD26 462 aa20.29■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.29■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 FCER1AP12319 257 aa20.28■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 RASA1P20936 1047 aa20.28■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 SBK1Q52WX2 424 aa20.28■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa20.28■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 APPBP2Q92624 585 aa20.28■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa20.28■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 MINDY4BA8MYZ0 360 aa20.27■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 M0R2C6 588 aa20.27■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 VWA5AO00534 786 aa20.27■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 SEPT4O43236 478 aa20.27■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC25A27O95847 323 aa20.27■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 MMP19Q99542 508 aa20.27■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.27■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 SMCHD1A6NHR9 2005 aa20.27■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 GPAA1O43292 621 aa20.26■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 PGK2P07205 417 aa20.26■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 LRIT3Q3SXY7 679 aa20.26■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 GIMAP6Q6P9H5 292 aa20.26■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 RIOX2Q8IUF8 465 aa20.26■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 REPS2Q8NFH8 660 aa20.26■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.26■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 A0A0C4DFX4 3053 aa20.25■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 RTP1P59025 263 aa20.25■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 KBTBD13C9JR72 458 aa20.24■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 STAT3P40763 770 aa20.24■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 TDO2P48775 406 aa20.24■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM47AQ5JRC9 791 aa20.24■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 ARRDC4Q8NCT1 418 aa20.24■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 CDH23Q9H251 3354 aa20.23■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 PRDM1O75626 825 aa20.23■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 NDUFB10O96000 172 aa20.23■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 KCTD2Q14681 263 aa20.23■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 GPR153Q6NV75 609 aa20.23■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 Q7L0L9 218 aa20.23■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 SLF1Q9BQI6 1058 aa20.23■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 NYAP2Q9P242 653 aa20.23■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa20.23■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa20.23■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 UNC80Q8N2C7 3258 aa20.23■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa20.22■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 F5H6K3 240 aa20.22■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 GNAT2P19087 354 aa20.22■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 KLRC3Q07444 240 aa20.22■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 LRRC41Q15345 812 aa20.22■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF792Q3KQV3 632 aa20.22■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 DEFB123Q8N688 67 aa20.22■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 PI4K2BQ8TCG2 481 aa20.22■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 TTC41PQ6P2S7 1318 aa20.22■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 APPP05067 770 aa20.21■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 COPB2P35606 906 aa20.21■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20.21■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 CEP95Q96GE4 821 aa20.21■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 TINF2Q9BSI4 451 aa20.21■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.21■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.21■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 EYSQ5T1H1 3165 aa20.21■□□□□ 0.83
SKIV2L-211ENST00000485349 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 ADCYAP1R1P41586 468 aa20.2■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 TRIM60Q495X7 471 aa20.2■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 IFNL3Q8IZI9 196 aa20.2■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 FERMT2Q96AC1 680 aa20.2■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa20.2■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 MCM3APO60318 1980 aa20.2■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 SNX17Q15036 470 aa20.19■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 FSD1Q9BTV5 496 aa20.19■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa20.19■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 NRBP1Q9UHY1 535 aa20.19■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 RIPK3Q9Y572 518 aa20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.5 ms