RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-208ENST00000482785 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa5.13□□□□□ -1.59
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SHQ1-208ENST00000482785 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa5.13□□□□□ -1.59
SHQ1-208ENST00000482785 TTC16Q8NEE8 873 aa5.13□□□□□ -1.59
SHQ1-208ENST00000482785 XAGE2Q96GT9 111 aa5.13□□□□□ -1.59
SHQ1-208ENST00000482785 CHMP4AQ9BY43 222 aa5.13□□□□□ -1.59
SHQ1-208ENST00000482785 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa5.13□□□□□ -1.59
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SHQ1-208ENST00000482785 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa5.11□□□□□ -1.59
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SHQ1-208ENST00000482785 NOS2P35228 1153 aa5.11□□□□□ -1.59
SHQ1-208ENST00000482785 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
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SHQ1-208ENST00000482785 FBN2P35556 2912 aa5.1□□□□□ -1.59
SHQ1-208ENST00000482785 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
SHQ1-208ENST00000482785 CGNL1Q0VF96 1302 aa5.09□□□□□ -1.59
SHQ1-208ENST00000482785 WNT7AO00755 349 aa5.09□□□□□ -1.59
SHQ1-208ENST00000482785 OPLAHO14841 1288 aa5.09□□□□□ -1.59
SHQ1-208ENST00000482785 SIAH2O43255 324 aa5.09□□□□□ -1.59
SHQ1-208ENST00000482785 CLSTN1O94985 981 aa5.09□□□□□ -1.59
SHQ1-208ENST00000482785 CAPN2P17655 700 aa5.09□□□□□ -1.59
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