RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481641.1

CLK1-211, Transcript of CDC like kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene CLK1, Length 690 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1-211ENST00000481641 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.19■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.19■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 TRPV1Q8NER1 839 aa22.19■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 PRO3102Q9H379 93 aa22.19■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 GOPCQ9HD26 462 aa22.19■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.19■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 PFASO15067 1338 aa22.19■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.19■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.18■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 STRNO43815 780 aa22.18■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 STAP2Q9UGK3 403 aa22.18■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 IGHA2P01877 340 aa22.17■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.17■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 MROH8Q9H579 483 aa22.17■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.17■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.17■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.16■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.16■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 NYAP2Q9P242 653 aa22.16■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.16■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.16■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.15■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 VWA5AO00534 786 aa22.15■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 COL6A1P12109 1028 aa22.15■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 CYBAP13498 195 aa22.15■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 SYN1P17600 705 aa22.15■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CLK1-211ENST00000481641 F5H6K3 240 aa22.14■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 NDUFB10O96000 172 aa22.14■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 KLRC3Q07444 240 aa22.14■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.14■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 ANO1Q5XXA6 986 aa22.14■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.14■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 REPS2Q8NFH8 660 aa22.14■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 MYH4Q9Y623 1939 aa22.14■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 SLC25A27O95847 323 aa22.13■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 FCER1AP12319 257 aa22.13■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 STAT3P40763 770 aa22.13■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 LRRC26Q2I0M4 334 aa22.13■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.13■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 RIOX2Q8IUF8 465 aa22.13■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.13■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 CEP95Q96GE4 821 aa22.13■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.13■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 NAPBQ9H115 298 aa22.13■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 SZT2Q5T011 3432 aa22.12■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 FOXP2O15409 715 aa22.12■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 PGK2P07205 417 aa22.12■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 MAML3Q96JK9 1138 aa22.12■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 MMP19Q99542 508 aa22.12■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.12■■□□□ 1.13
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CLK1-211ENST00000481641 INCENPQ9NQS7 918 aa22.11■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 SLC5A4Q9NY91 659 aa22.11■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.11■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 TFAP4Q01664 338 aa22.1■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.1■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.1■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 GDF15Q99988 308 aa22.1■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 DNAH12Q6ZR08 3092 aa22.09■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 MSCO60682 206 aa22.09■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 TSPY3P0CV98 308 aa22.09■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 TSPY8P0CW00 308 aa22.09■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 SLC4A3P48751 1232 aa22.09■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 PDE4BQ07343 736 aa22.09■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 VPS53Q5VIR6 699 aa22.09■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.09■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 MKL1Q969V6 931 aa22.09■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 EVI5LQ96CN4 794 aa22.09■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 RIPK3Q9Y572 518 aa22.09■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.09■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 TTLL1O95922 423 aa22.08■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 KCTD2Q14681 263 aa22.08■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 KIFC2Q96AC6 838 aa22.08■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 LNPKQ9C0E8 428 aa22.08■■□□□ 1.13
CLK1-211ENST00000481641 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.07■■□□□ 1.12
CLK1-211ENST00000481641 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.07■■□□□ 1.12
CLK1-211ENST00000481641 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CLK1-211ENST00000481641 SEPT4O43236 478 aa22.07■■□□□ 1.12
CLK1-211ENST00000481641 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CLK1-211ENST00000481641 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CLK1-211ENST00000481641 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CLK1-211ENST00000481641 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.07■■□□□ 1.12
CLK1-211ENST00000481641 CPXCR1Q8N123 301 aa22.07■■□□□ 1.12
CLK1-211ENST00000481641 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
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