RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, human

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C9orf3-215	ENST00000478473	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		27.87	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	CEP95	Q96GE4	821 aa		27.87	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		27.87	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		27.87	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	TRIM32	Q13049	653 aa		27.86	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	DEFB118	Q96PH6	123 aa		27.86	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	MROH8	Q9H579	483 aa		27.86	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		27.85	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	TTLL1	O95922	423 aa		27.85	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	SDS	P20132	328 aa		27.85	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	NOV	P48745	357 aa		27.85	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		27.85	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		27.85	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		27.85	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		27.85	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	ORC4	O43929	436 aa		27.84	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	NDUFB10	O96000	172 aa		27.84	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	FGA	P02671	866 aa		27.84	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		27.84	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		27.84	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		27.84	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	REPS2	Q8NFH8	660 aa		27.84	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	VWA5A	O00534	786 aa		27.83	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	TSPY3	P0CV98	308 aa		27.83	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	TSPY8	P0CW00	308 aa		27.83	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	ERCC3	P19447	782 aa		27.83	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	TFAP4	Q01664	338 aa		27.83	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	CCL14	Q16627	93 aa		27.83	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		27.83	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		27.83	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	RILPL2	Q969X0	211 aa		27.83	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		27.83	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		27.83	■■■□□ 2.05
C9orf3-215	ENST00000478473	SLC25A27	O95847	323 aa		27.82	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		27.82	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	MYH4	Q9Y623	1939 aa		27.8	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	ATP2A1	O14983	1001 aa		27.8	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		27.8	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		27.8	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	WDR78	Q5VTH9	848 aa		27.8	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		27.8	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		27.8	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		27.8	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	HIP1	O00291	1037 aa		27.79	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	PDE4A	P27815	886 aa		27.79	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	ADORA2A	P29274	412 aa		27.79	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	COPB2	P35606	906 aa		27.79	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		27.79	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		27.79	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		27.79	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	GMCL1	Q96IK5	515 aa		27.78	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	INCENP	Q9NQS7	918 aa		27.78	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	STAT3	P40763	770 aa		27.77	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		27.77	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	FEM1B	Q9UK73	627 aa		27.77	■■■□□ 2.04
C9orf3-215	ENST00000478473	TSPY2	A6NKD2	308 aa		27.76	■■■□□ 2.03
C9orf3-215	ENST00000478473	PLA2G6	O60733	806 aa		27.76	■■■□□ 2.03
C9orf3-215	ENST00000478473	COBL	O75128	1261 aa		27.76	■■■□□ 2.03
C9orf3-215	ENST00000478473	PLS1	Q14651	629 aa		27.76	■■■□□ 2.03
C9orf3-215	ENST00000478473	LHX8	Q68G74	356 aa		27.76	■■■□□ 2.03
C9orf3-215	ENST00000478473	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	27.76	■■■□□ 2.03
C9orf3-215	ENST00000478473	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		27.76	■■■□□ 2.03
C9orf3-215	ENST00000478473	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		27.76	■■■□□ 2.03
C9orf3-215	ENST00000478473	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		27.76	■■■□□ 2.03
C9orf3-215	ENST00000478473	RAD21	O60216	631 aa		27.75	■■■□□ 2.03
C9orf3-215	ENST00000478473	FDX1	P10109	184 aa		27.75	■■■□□ 2.03
C9orf3-215	ENST00000478473	NT5C2	P49902	561 aa		27.75	■■■□□ 2.03
C9orf3-215	ENST00000478473	SLFN13	Q68D06	897 aa		27.75	■■■□□ 2.03
C9orf3-215	ENST00000478473	DPP9	Q86TI2	863 aa		27.75	■■■□□ 2.03
C9orf3-215	ENST00000478473	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
C9orf3-215	ENST00000478473	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		27.75	■■■□□ 2.03
C9orf3-215	ENST00000478473	FCER1A	P12319	257 aa		27.74	■■■□□ 2.03
C9orf3-215	ENST00000478473	NBPF3	Q9H094	633 aa		27.74	■■■□□ 2.03
C9orf3-215	ENST00000478473	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		27.74	■■■□□ 2.03
C9orf3-215	ENST00000478473	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		27.74	■■■□□ 2.03
C9orf3-215	ENST00000478473	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
C9orf3-215	ENST00000478473	BMP3	P12645	472 aa		27.73	■■■□□ 2.03
C9orf3-215	ENST00000478473	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
C9orf3-215	ENST00000478473	OAZ1	P54368	228 aa		27.73	■■■□□ 2.03
C9orf3-215	ENST00000478473	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
C9orf3-215	ENST00000478473	TTC22	Q5TAA0	569 aa		27.73	■■■□□ 2.03
C9orf3-215	ENST00000478473	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		27.73	■■■□□ 2.03
C9orf3-215	ENST00000478473	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		27.73	■■■□□ 2.03

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