RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477965.1

RBMS1-212, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene RBMS1, Length 2,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-212ENST00000477965 MAP3K14Q99558 947 aa7.16□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 TSGA10Q9BZW7 698 aa7.16□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 ZRANB1Q9UGI0 708 aa7.16□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 TRPC6Q9Y210 931 aa7.16□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 UTYO14607 1347 aa7.16□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 COL15A1P39059 1388 aa7.16□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 A0A0U1RQJ8 604 aa7.15□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 GMNCA6NCL1 334 aa7.15□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 CFAP73A6NFT4 308 aa7.15□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 E7EWF7 191 aa7.15□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 CDKL5O76039 1030 aa7.15□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 SCTRP47872 440 aa7.15□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 PTPN21Q16825 1174 aa7.15□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 CFAP58Q5T655 872 aa7.15□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa7.15□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 CCDC155Q8N6L0 562 aa7.15□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 CPLX3Q8WVH0 158 aa7.15□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 ATRIPQ8WXE1 791 aa7.15□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 CYFIP2Q96F07 1278 aa7.15□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 LRRC2Q9BYS8 371 aa7.15□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 GUCA1BQ9UMX6 200 aa7.15□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 C15orf41Q9Y2V0 281 aa7.15□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 MAP3K19Q56UN5 1328 aa7.15□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 ABCA3Q99758 1704 aa7.15□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RBMS1-212ENST00000477965 PI4KAP2A4QPH2 592 aa7.15□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 ABLIM1O14639 778 aa7.15□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 CPLX1O14810 134 aa7.15□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 ZNF609O15014 1411 aa7.15□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 ATP6V1G2O95670 118 aa7.15□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 TFRCP02786 760 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 FERP16591 822 aa7.15□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 CCDC122Q5T0U0 273 aa7.15□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa7.15□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 LRIG3Q6UXM1 1119 aa7.15□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 IFT20Q8IY31 132 aa7.15□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 TEX9Q8N6V9 391 aa7.15□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa7.15□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa7.15□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 ZIM3Q96PE6 472 aa7.15□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 SLF1Q9BQI6 1058 aa7.15□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 NOD2Q9HC29 1040 aa7.15□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 STIM2Q9P246 746 aa7.15□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 RNF14Q9UBS8 474 aa7.15□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 PALLDQ8WX93 1383 aa7.14□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 IGSF1Q8N6C5 1336 aa7.14□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa7.14□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 E7EVH7 732 aa7.14□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 FOXO3O43524 673 aa7.14□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 TCP1P17987 556 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 RAB27AP51159 221 aa7.14□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 E2F5Q15329 346 aa7.14□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 MSL1Q68DK7 614 aa7.14□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa7.14□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 ZFAND2BQ8WV99 257 aa7.14□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 ACSBG1Q96GR2 724 aa7.14□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa7.14□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 HAUS7Q99871 368 aa7.14□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 OSBPL7Q9BZF2 842 aa7.14□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 RABEP2Q9H5N1 569 aa7.14□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 HAUS2Q9NVX0 235 aa7.14□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa7.14□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa7.13□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 GOLGA6L10A6NI86 522 aa7.13□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 KIF28PB7ZC32 967 aa7.13□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 PAEPP09466 180 aa7.13□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 KRT9P35527 623 aa7.13□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 GUCY1A3Q02108 690 aa7.13□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 PAK2Q13177 524 aa7.13□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 CUL4BQ13620 913 aa7.13□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 KCNB1Q14721 858 aa7.13□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 SLC30A9Q6PML9 568 aa7.13□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 KBTBD3Q8NAB2 608 aa7.13□□□□□ -1.27
RBMS1-212ENST00000477965 KLHL23Q8NBE8 558 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms