RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476784.5

TTC3-215, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTC3, Length 7,425 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-215ENST00000476784 PLCB1Q9NQ66 1216 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.233e-10■□□□□ 8.4
TTC3-215ENST00000476784 TPCN1Q9ULQ1 816 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 PRR23AA6NEV1 266 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 TMEM232C9JQI7 657 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 ASIC2Q16515 512 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 DNAJC10Q8IXB1 793 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 GLT8D2Q9H1C3 349 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 K7ENM7 598 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 KCNA6P17658 529 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 THEM5Q8N1Q8 247 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 TEKT4Q8WW24 435 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 CTNND2Q9UQB3 1225 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 CUX1P39880 1505 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 ARHGEF37A1IGU5 675 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 SUPT3HB4E1H0 165 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 ASMTLO95671 621 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 YY1P25490 414 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 CTDSPL2Q05D32 466 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 PPFIBP2Q8ND30 876 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 SSH1Q8WYL5 1049 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 FGD4Q96M96 766 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 WIZO95785 1651 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 NCOA2Q15596 1464 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 MYL1P05976 194 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 RPS8P62241 208 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 FAM160A1Q05DH4 1040 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 LZICQ8WZA0 190 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 ZSCAN32Q9NX65 697 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 ERBB3P21860 1342 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 BRD1O95696 1058 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 BRD3Q15059 726 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 MFSD4BQ5TF39 518 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 ASIC3Q9UHC3 531 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 V9GY48 417 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 WDR17Q8IZU2 1322 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 NDUFB5O43674 189 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 DDHD2O94830 711 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 GDF11O95390 407 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 PRR23CQ6ZRP0 262 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 RAPH1Q70E73 1250 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 FBXO11Q86XK2 927 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 OTUD5Q96G74 571 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 GUCA1BQ9UMX6 200 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 TRIM31Q9BZY9 425 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 FAM114A2Q9NRY5 505 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 IL16Q14005 1332 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 SERPINB2P05120 415 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 LMNB1P20700 586 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 TIMM10P62072 90 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 TFAP4Q01664 338 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 WASHC5Q12768 1159 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 CEP85LQ5SZL2 805 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 KSR1Q8IVT5 923 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 CEP120Q8N960 986 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 NLRP4Q96MN2 994 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 LRRC4Q9HBW1 653 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 F8W8V4 182 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 TBC1D8O95759 1140 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 GLYCTKQ8IVS8 523 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 POLR3EQ9NVU0 708 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 SWAP70Q9UH65 585 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 TEX14Q8IWB6 1497 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 BCRP11274 1271 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 NESP48681 1621 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 VCPP55072 806 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 UBL4BQ8N7F7 174 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 CCNYQ8ND76 341 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 TEKT3Q9BXF9 490 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 HFM1A2PYH4 1435 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 CCND2P30279 289 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 ATP2A3Q93084 1043 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 RILPQ96NA2 401 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 SYTL2Q9HCH5 934 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 IFNB1P01574 187 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC3-215ENST00000476784 KAZNQ674X7 775 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms