RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472427.5

RALGPS1-212, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2

Gene RALGPS1, Length 764 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-212ENST00000472427 MYPNQ86TC9 1320 aa25.5■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 NKX2-3Q8TAU0 364 aa25.5■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 PCNTO95613 3336 aa25.49■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa25.49■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 TMTC2Q8N394 836 aa25.49■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 CPA4Q9UI42 421 aa25.49■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 FEM1BQ9UK73 627 aa25.49■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 FKTNO75072 461 aa25.48■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 LBX1P52954 281 aa25.48■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 FGD1P98174 961 aa25.48■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 SP3Q02447 781 aa25.48■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 KIF22Q14807 665 aa25.48■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 SEC23AQ15436 765 aa25.48■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 ADGRA2Q96PE1 1338 aa25.47■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 ANTXR2P58335 489 aa25.47■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 ANAPC15P60006 121 aa25.47■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 ARHGEF6Q15052 776 aa25.47■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 C17orf99Q6UX52 265 aa25.47■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 NFXL1Q6ZNB6 911 aa25.47■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 CATIPQ7Z7H3 387 aa25.47■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM160B2Q86V87 743 aa25.47■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 CHURC1Q8WUH1 139 aa25.47■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 ERO1AQ96HE7 468 aa25.47■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 SLF1Q9BQI6 1058 aa25.47■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 CCDC69A6NI79 296 aa25.46■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 STAT2P52630 851 aa25.46■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM110CQ1W6H9 321 aa25.46■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 ADCK5Q3MIX3 580 aa25.46■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 LBX2Q6XYB7 198 aa25.46■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa25.46■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 MB21D1Q8N884 522 aa25.46■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa25.46■■□□□ 1.67
RALGPS1-212ENST00000472427 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 TMEM232C9JQI7 657 aa25.45■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 CASTP20810 708 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 DSG3P32926 999 aa25.45■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 PAGR1Q9BTK6 254 aa25.45■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa25.45■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa25.45■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 PDHBP11177 359 aa25.44■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 BCRP11274 1271 aa25.44■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 LIFRP42702 1097 aa25.44■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.44■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 KCTD1Q719H9 257 aa25.44■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa25.44■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa25.44■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 CHMP4CQ96CF2 233 aa25.44■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 TM6SF1Q9BZW5 370 aa25.44■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.44■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa25.44■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 FDX1P10109 184 aa25.43■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 CCNA1P78396 465 aa25.43■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 ASPRV1Q53RT3 343 aa25.43■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 KIFC2Q96AC6 838 aa25.43■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 LY9Q9HBG7 655 aa25.43■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 MORF4L1Q9UBU8 362 aa25.43■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 PLA2G6O60733 806 aa25.42■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 ZBED4O75132 1171 aa25.42■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 SEC24BO95487 1268 aa25.42■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 RPS6KB1P23443 525 aa25.42■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 ATG4CQ96DT6 458 aa25.42■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 FBXO28Q9NVF7 368 aa25.42■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 DDAH1O94760 285 aa25.41■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 CALM1P0DP23 149 aa25.41■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 CALM2P0DP24 149 aa25.41■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 CALM3P0DP25 149 aa25.41■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 SNHG28P0DPA3 235 aa25.41■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 ERVK-9P63128 1117 aa25.41■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 ERVK-24P63145 666 aa25.41■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF543Q08ER8 600 aa25.41■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 LRRC2Q9BYS8 371 aa25.41■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 GPCPD1Q9NPB8 672 aa25.41■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC12A7Q9Y666 1083 aa25.41■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 PARP14Q460N5 1801 aa25.4■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 RUFY3Q7L099 469 aa25.4■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 RBPJLQ9UBG7 517 aa25.4■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 A0A0G2JMZ2 1700 aa25.4■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 VWA5AO00534 786 aa25.39■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 FCGRTP55899 365 aa25.39■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 PLS1Q14651 629 aa25.39■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF654Q8IZM8 581 aa25.39■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 CD99L2Q8TCZ2 262 aa25.39■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa25.39■■□□□ 1.66
RALGPS1-212ENST00000472427 KIF5BP33176 963 aa25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms