RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468534.1

CCDC88A-210, Transcript of coiled-coil domain containing 88A, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC88A, Length 536 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCDC88A-210ENST00000468534 USP2O75604 605 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
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CCDC88A-210ENST00000468534 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.14□□□□□ -1.27
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CCDC88A-210ENST00000468534 SLC14A2Q15849 920 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC88A-210ENST00000468534 ADGRF1Q5T601 910 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC88A-210ENST00000468534 RNF111Q6ZNA4 994 aa7.11□□□□□ -1.27
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CCDC88A-210ENST00000468534 SNX17Q15036 470 aa7.09□□□□□ -1.27
CCDC88A-210ENST00000468534 NBPF9Q3BBW0 867 aa7.09□□□□□ -1.27
CCDC88A-210ENST00000468534 TAF7LQ5H9L4 462 aa7.09□□□□□ -1.27
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CCDC88A-210ENST00000468534 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
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CCDC88A-210ENST00000468534 SEMA7AO75326 666 aa7.08□□□□□ -1.28
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CCDC88A-210ENST00000468534 ATE1O95260 518 aa7.08□□□□□ -1.28
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CCDC88A-210ENST00000468534 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CCDC88A-210ENST00000468534 ATG4CQ96DT6 458 aa7.08□□□□□ -1.28
CCDC88A-210ENST00000468534 MAP6Q96JE9 813 aa7.08□□□□□ -1.28
CCDC88A-210ENST00000468534 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.08□□□□□ -1.28
CCDC88A-210ENST00000468534 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CCDC88A-210ENST00000468534 ANTXR1Q9H6X2 564 aa7.08□□□□□ -1.28
CCDC88A-210ENST00000468534 KCNQ5Q9NR82 932 aa7.08□□□□□ -1.28
CCDC88A-210ENST00000468534 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa7.08□□□□□ -1.28
CCDC88A-210ENST00000468534 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CCDC88A-210ENST00000468534 ZNF281Q9Y2X9 895 aa7.08□□□□□ -1.28
CCDC88A-210ENST00000468534 APOBRQ0VD83 1088 aa7.07□□□□□ -1.28
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