RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 FERMT3Q86UX7 667 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPN3-209ENST00000466222 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CAPN3-209ENST00000466222 PDHBP11177 359 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPN3-209ENST00000466222 TERF1P54274 439 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPN3-209ENST00000466222 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CAPN3-209ENST00000466222 SULF1Q8IWU6 871 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPN3-209ENST00000466222 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CAPN3-209ENST00000466222 NYAP2Q9P242 653 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPN3-209ENST00000466222 V9GY48 417 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CAPN3-209ENST00000466222 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPN3-209ENST00000466222 OFD1O75665 1012 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 CDKL5O76039 1030 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 SSC5DA1L4H1 1573 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 CYTH3O43739 400 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 MKL1Q969V6 931 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 ALG1Q9BT22 464 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 UBA5Q9GZZ9 404 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 RRAGCQ9HB90 399 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 IQCA1LA6NCM1 817 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 KIF5BP33176 963 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 PPP2R5BQ15173 497 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 GPCPD1Q9NPB8 672 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 KLRF2D3W0D1 207 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 PDCP20941 246 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 PKN1Q16512 942 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 KCTD1Q719H9 257 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 SPICE1Q8N0Z3 855 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 SHISA4Q96DD7 197 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 WRNIP1Q96S55 665 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 CNPY2Q9Y2B0 182 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 F5H6K3 240 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 H3BQV1 296 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 SNHG28P0DPA3 235 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 KLRC3Q07444 240 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 IFFO2Q5TF58 517 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 TTBK2Q6IQ55 1244 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 FAM173BQ6P4H8 233 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 MAP3K14Q99558 947 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 GDPD2Q9HCC8 539 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 VAT1LQ9HCJ6 419 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 DGKZQ13574 1117 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 C8orf76Q96K31 380 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF341Q9BYN7 854 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 ASNSP08243 561 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 SLC16A2P36021 539 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 DCAF15Q66K64 600 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 SLFN13Q68D06 897 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 KLRG1Q96E93 195 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF112Q9UJU3 913 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 USP2O75604 605 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 NDUFB10O96000 172 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF543Q08ER8 600 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 MOB2Q70IA6 237 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 NMRK2Q9NPI5 230 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 STK36Q9NRP7 1315 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPN3-209ENST00000466222 DEXIO95424 95 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC96Q2M329 555 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 KCNJ14Q9UNX9 436 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 TMX2Q9Y320 296 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 KIF3AQ9Y496 699 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 SLC1A4P43007 532 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 CDCA5Q96FF9 252 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 VPS54Q9P1Q0 977 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 TRAF5O00463 557 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 KRT40Q6A162 431 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 HOMER1Q86YM7 354 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 RNF214Q8ND24 703 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 GNAQP50148 359 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 ASPRV1Q53RT3 343 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 TCHHQ07283 1943 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 KIF28PB7ZC32 967 aa21.42■■□□□ 1.02
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