RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	20.93	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	20.92	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	DSG3	P32926	999 aa		20.92	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	TRDN	Q13061	729 aa		20.92	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		20.92	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		20.92	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	MYPN	Q86TC9	1320 aa		20.92	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	CENPF	P49454	3210 aa		20.91	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	CYP21A2	P08686	494 aa		20.91	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	PLS1	Q14651	629 aa		20.91	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902		Q3C1V9	767 aa		20.91	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	WDR78	Q5VTH9	848 aa		20.91	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	IQCA1	Q86XH1	822 aa		20.91	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		20.91	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		20.91	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	RAET1E	Q8TD07	263 aa		20.91	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	ATG4C	Q96DT6	458 aa		20.91	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	20.91	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		20.91	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	SRRD	Q9UH36	339 aa		20.91	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		20.91	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	MCC	P23508	829 aa		20.9	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	PRMT2	P55345	433 aa		20.9	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	CCNA1	P78396	465 aa		20.9	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	20.9	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		20.9	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	LBX2	Q6XYB7	198 aa		20.9	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	BTBD7	Q9P203	1132 aa		20.9	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		20.9	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	CNMD	O75829	334 aa		20.89	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	20.89	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	BMP3	P12645	472 aa		20.89	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	SLC1A4	P43007	532 aa		20.89	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	NT5C2	P49902	561 aa		20.89	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	PRKCZ	Q05513	592 aa		20.89	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	20.89	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		20.89	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		20.89	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		20.89	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	PORCN	Q9H237	461 aa		20.89	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	GABRQ	Q9UN88	632 aa		20.89	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	20.89	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	MAPK4	P31152	587 aa		20.88	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	CCDC96	Q2M329	555 aa		20.88	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		20.88	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		20.88	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	MB21D1	Q8N884	522 aa		20.88	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	KIFC2	Q96AC6	838 aa		20.88	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	TTC14	Q96N46	770 aa		20.88	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		20.88	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902		E7EWF7	191 aa		20.87	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	FLT3LG	P49771	235 aa		20.87	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	20.87	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	GMCL1	Q96IK5	515 aa		20.87	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	20.87	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	FEM1B	Q9UK73	627 aa		20.87	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		20.87	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	TMEM232	C9JQI7	657 aa		20.86	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	NOV	P48745	357 aa		20.86	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	KCTD1	Q719H9	257 aa		20.86	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	NBPF11	Q86T75	865 aa		20.86	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	NCOA7	Q8NI08	942 aa		20.86	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	ZNF333	Q96JL9	665 aa		20.86	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		20.86	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	20.86	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902		A0A0G2JMZ2	1700 aa		20.86	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	TNKS	O95271	1327 aa		20.85	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	VWA5A	O00534	786 aa		20.85	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	20.85	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	SLC4A3	P48751	1232 aa		20.85	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	STAT2	P52630	851 aa		20.85	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		20.85	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		20.85	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		20.85	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		20.85	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	GPR142	Q7Z601	462 aa		20.85	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		20.85	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	DGKH	Q86XP1	1220 aa		20.85	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		20.85	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		20.85	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	DCAF4	Q8WV16	495 aa		20.85	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	20.85	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	KAT14	Q9H8E8	782 aa		20.85	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		20.85	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	20.85	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	PLXNB2	O15031	1838 aa		20.84	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	POTEF	A5A3E0	1075 aa		20.84	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	SLC27A2	O14975	620 aa		20.84	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	ZBED4	O75132	1171 aa		20.84	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	20.84	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		20.84	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	RNF20	Q5VTR2	975 aa		20.84	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		20.84	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	20.84	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		20.84	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		20.84	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	20.84	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	20.83	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	ERICH2	A1L162	156 aa		20.83	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	ADCY3	O60266	1144 aa		20.83	■□□□□ 0.93

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