RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460331.5

ZNF3-211, Transcript of zinc finger protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF3, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3-211ENST00000460331 SNAPC2Q13487 334 aa14.51□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 CUL4AQ13619 759 aa14.51□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 RGMBQ6NW40 437 aa14.51□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa14.51□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 CCDC83Q8IWF9 413 aa14.51□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 NECAB1Q8N987 351 aa14.51□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 WNK4Q96J92 1243 aa14.51□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 HHIPL1Q96JK4 782 aa14.51□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 KCNH4Q9UQ05 1017 aa14.51□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 OTOFQ9HC10 1997 aa14.51□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 UTRNP46939 3433 aa14.5□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 KLRF2D3W0D1 207 aa14.5□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 IRF6O14896 467 aa14.5□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 ADD1P35611 737 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 GTF2A2P52657 109 aa14.5□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 HMGCS2P54868 508 aa14.5□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 SPRYD7Q5W111 196 aa14.5□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 CHURC1Q8WUH1 139 aa14.5□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 CCDC102AQ96A19 550 aa14.5□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 GPCPD1Q9NPB8 672 aa14.5□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 EMILIN3Q9NT22 766 aa14.5□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 MAD2L2Q9UI95 211 aa14.5□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 CETPP11597 493 aa14.49□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 IFNAR1P17181 557 aa14.49□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 CDC27P30260 824 aa14.49□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 APLP1P51693 650 aa14.49□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.49□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 FAM160B2Q86V87 743 aa14.49□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.49□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.49□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.49□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 CREBZFQ9NS37 354 aa14.49□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 FEM1BQ9UK73 627 aa14.49□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 KIF3AQ9Y496 699 aa14.49□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 TMEM232C9JQI7 657 aa14.48□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 PLA2G6O60733 806 aa14.48□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 GOLGA8HP0CJ92 632 aa14.48□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 VCAM1P19320 739 aa14.48□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 STAT2P52630 851 aa14.48□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 FAM83BQ5T0W9 1011 aa14.48□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 GADL1Q6ZQY3 521 aa14.48□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 KCTD1Q719H9 257 aa14.48□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 STAG2Q8N3U4 1231 aa14.48□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 SPZ1Q9BXG8 430 aa14.48□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.48□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 USP17L15C9J2P7 530 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 USP17L13C9JLJ4 530 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 USP17L11C9JVI0 530 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 USP17L18D6R9N7 530 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 USP17L22D6RA61 530 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 USP17L17D6RBQ6 530 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 USP17L19D6RCP7 530 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 USP17L20D6RJB6 530 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 USP17L24Q0WX57 530 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 BTNL9Q6UXG8 535 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 RASAL3Q86YV0 1011 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 WASF1Q92558 559 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 PHIPQ8WWQ0 1821 aa14.47□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 PLEKHA8P1O95397 391 aa14.46□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 SLC10A3P09131 477 aa14.46□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 FDX1P10109 184 aa14.46□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 GJA5P36382 358 aa14.46□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 INHBEP58166 350 aa14.46□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 NTRK3Q16288 839 aa14.46□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 DEFB115Q30KQ5 88 aa14.46□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa14.46□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.46□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 FAM184AQ8NB25 1140 aa14.46□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 UBA5Q9GZZ9 404 aa14.46□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 RIOX1Q9H6W3 641 aa14.46□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
ZNF3-211ENST00000460331 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms