RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 STAMQ92783 540 aa18.18■□□□□ 0.5
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SHQ1-202ENST00000444040 NFIXQ14938 502 aa18.18■□□□□ 0.5
SHQ1-202ENST00000444040 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
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SHQ1-202ENST00000444040 USP17L1Q7RTZ2 530 aa18.16■□□□□ 0.5
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SHQ1-202ENST00000444040 RPN1P04843 607 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
SHQ1-202ENST00000444040 GPSM2P81274 684 aa18.11■□□□□ 0.49
SHQ1-202ENST00000444040 KARSQ15046 597 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
SHQ1-202ENST00000444040 FILIP1LQ4L180 1135 aa18.11■□□□□ 0.49
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SHQ1-202ENST00000444040 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
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