RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 ATP2B2Q01814 1243 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRJ-202ENST00000440289 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRJ-202ENST00000440289 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PTPRJ-202ENST00000440289 STX8Q9UNK0 236 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRJ-202ENST00000440289 DUSP10Q9Y6W6 482 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRJ-202ENST00000440289 B4DLN1 442 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 PRCPP42785 496 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 CASP8Q14790 479 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 PKN1Q16512 942 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 STAG1Q8WVM7 1258 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 WDR19Q8NEZ3 1342 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 ATP6V1AP38606 617 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 CTAGE1Q96RT6 745 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 MYO6Q9UM54 1294 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 TTC26A0AVF1 554 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 CXCR5P32302 372 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 PANX2Q96RD6 677 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 FBXO3Q9UK99 471 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 TMTC2Q8N394 836 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 ABCC12Q96J65 1359 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 MROH5Q6ZUA9 1318 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 NWD2Q9ULI1 1742 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 TRIML1Q8N9V2 468 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 KLRK1P26718 216 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 UBA7P41226 1012 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 INF2Q27J81 1249 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 CYP26C1Q6V0L0 522 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM204AQ9H8W3 233 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 PTPROQ16827 1216 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 CCDC148Q8NFR7 591 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 STK36Q9NRP7 1315 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 CCDC152Q4G0S7 254 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 KRT26Q7Z3Y9 468 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 MTRQ99707 1265 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 RAD21O60216 631 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 MMS19Q96T76 1030 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 MCM9Q9NXL9 1143 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 MYO1CO00159 1063 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 BRD3Q15059 726 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 TCP11X2Q5H9J9 407 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 TMTC1Q8IUR5 882 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 DYNLL2Q96FJ2 89 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 GSDMAQ96QA5 445 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 C2orf54Q08AI8 447 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 PLA2G12BQ9BX93 195 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 NDUFA10O95299 355 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 GNAT2P19087 354 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 CCDC96Q2M329 555 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM182BQ5T319 152 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 STAG2Q8N3U4 1231 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 PHF20Q9BVI0 1012 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC7A5Q01650 507 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 IL17AQ16552 155 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-202ENST00000440289 CAVIN4Q5BKX8 364 aa20.52■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 NT5DC1Q5TFE4 455 aa20.52■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 DEF6Q9H4E7 631 aa20.52■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 EHD2Q9NZN4 543 aa20.52■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 USP17L8P0C7I0 530 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 IDEP14735 1019 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 FGFR2P21802 821 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 PRDX5P30044 214 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 LETM2Q2VYF4 491 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 CTR9Q6PD62 1173 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 EXOC5O00471 708 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms