RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 ZNF710Q8N1W2 664 aa31.45■■■□□ 2.63
CERS1-201ENST00000429504 SLC44A5Q8NCS7 719 aa31.45■■■□□ 2.63
CERS1-201ENST00000429504 EP400Q96L91 3159 aa31.45■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 SLF2Q8IX21 1173 aa31.45■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 INTS13Q9NVM9 706 aa31.45■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 SNED1Q8TER0 1413 aa31.45■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 TOP1P11387 765 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 DPYDQ12882 1025 aa31.44■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 C16orf86Q6ZW13 317 aa31.44■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa31.44■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 CRAMP1Q96RY5 1269 aa31.44■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 GALNT17Q6IS24 598 aa31.44■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 DAGLBQ8NCG7 672 aa31.44■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 CCDC148Q8NFR7 591 aa31.44■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP31.44■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 LZTS2Q9BRK4 669 aa31.44■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 MCM7P33993 719 aa31.43■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 AFMP43652 599 aa31.43■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 E2F4Q16254 413 aa31.43■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 TEX11Q8IYF3 940 aa31.43■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 IQUBQ8NA54 791 aa31.43■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 TBC1D16Q8TBP0 767 aa31.43■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 MED15Q96RN5 788 aa31.43■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 TMEM47Q9BQJ4 181 aa31.43■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 GAKO14976 1311 aa31.43■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 M0R2N6 131 aa31.42■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 ADAMTS3O15072 1205 aa31.42■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 MFSD14BQ5SR56 506 aa31.42■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 TMX1Q9H3N1 280 aa31.42■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 TMEM232C9JQI7 657 aa31.42■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP31.42■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 POLLQ9UGP5 575 aa31.42■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 STX8Q9UNK0 236 aa31.42■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 FLT1P17948 1338 aa31.41■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 FAM205AQ6ZU69 1335 aa31.41■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 SYCP1Q15431 976 aa31.41■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 TMC4Q7Z404 712 aa31.41■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 CDK8P49336 464 aa31.4■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 DDR1Q08345 913 aa31.4■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 SLC35G1Q2M3R5 365 aa31.4■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa31.4■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 CYTH3O43739 400 aa31.4■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 LONP1P36776 959 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 RHBDL3P58872 404 aa31.4■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 IL17AQ16552 155 aa31.4■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 TYW1BQ6NUM6 668 aa31.4■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 C4orf32Q8N8J7 132 aa31.4■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 BARHL2Q9NY43 387 aa31.4■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 CUL4BQ13620 913 aa31.39■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 WWC2Q6AWC2 1192 aa31.39■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 NEDD1Q8NHV4 660 aa31.39■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 ZNF592Q92610 1267 aa31.39■■■□□ 2.62
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CERS1-201ENST00000429504 CCP110O43303 1012 aa31.39■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 SPZ1Q9BXG8 430 aa31.39■■■□□ 2.62
CERS1-201ENST00000429504 PDXDC2PQ6P474 469 aa31.38■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 KIF18AQ8NI77 898 aa31.38■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 BRWD3Q6RI45 1802 aa31.38■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa31.38■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa31.37■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 TUBB4AP04350 444 aa31.37■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 SPATA1Q5VX52 437 aa31.37■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 ANKRD7Q92527 254 aa31.37■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa31.37■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 STXBP3O00186 592 aa31.37■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa31.37■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa31.36■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 PCDHA6Q9UN73 950 aa31.36■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa31.36■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 MYH8P13535 1937 aa31.36■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 CD44P16070 742 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 CASP1P29466 404 aa31.36■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa31.36■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 QSER1Q2KHR3 1735 aa31.35■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 KLRF2D3W0D1 207 aa31.35■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 TXLNAP40222 546 aa31.35■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 FCHSD1Q86WN1 690 aa31.35■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 A0A1B0GTH6 734 aa31.34■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 C6orf229H3BNL8 230 aa31.34■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 SP8Q8IXZ3 490 aa31.34■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 RASGRP4Q8TDF6 673 aa31.34■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa31.34■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP31.34■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 NOVP48745 357 aa31.34■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 SMARCA1P28370 1054 aa31.33■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 NR1I3Q14994 352 aa31.33■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 TMEM139Q8IV31 216 aa31.33■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
CERS1-201ENST00000429504 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa31.33■■■□□ 2.61
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