RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BRCA2P51587 3418 aa29.54■■■□□ 2.32
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 IRF5Q13568 498 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GPR142Q7Z601 462 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A0A0G2JMZ2 1700 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MYH4Q9Y623 1939 aa29.53■■■□□ 2.32
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa29.52■■■□□ 2.32
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 NBPF11Q86T75 865 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MB21D1Q8N884 522 aa29.52■■■□□ 2.32
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPATC1LQ9H0A9 340 aa29.51■■■□□ 2.31
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHMP4CQ96CF2 233 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GMCL1Q96IK5 515 aa29.49■■■□□ 2.31
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPP4R2Q9NY27 417 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLXNB2O15031 1838 aa29.49■■■□□ 2.31
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 B4E1Z4 1266 aa29.47■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CYP21A2P08686 494 aa29.47■■■□□ 2.31
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa29.47■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TAF6LQ9Y6J9 622 aa29.47■■■□□ 2.31
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 NT5C2P49902 561 aa29.44■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIFC2Q96AC6 838 aa29.44■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 GRB14Q14449 540 aa29.43■■■□□ 2.3
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRT23Q9C075 422 aa29.43■■■□□ 2.3
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa29.41■■■□□ 2.3
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MROH8Q9H579 483 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCL5P13501 91 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STAT2P52630 851 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UBXN2AP68543 259 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRIM32Q13049 653 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCL14Q16627 93 aa29.4■■■□□ 2.3
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