RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421164.5

AFG3L1P-204, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene AFG3L1P, Length 1,706 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-204ENST00000421164 APLP1P51693 650 aa20.33■□□□□ 0.84
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AFG3L1P-204ENST00000421164 LPAR1Q92633 364 aa20.3■□□□□ 0.84
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AFG3L1P-204ENST00000421164 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
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AFG3L1P-204ENST00000421164 ZIC5Q96T25 663 aa20.27■□□□□ 0.83
AFG3L1P-204ENST00000421164 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa20.26■□□□□ 0.83
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AFG3L1P-204ENST00000421164 GTF2A2P52657 109 aa20.26■□□□□ 0.83
AFG3L1P-204ENST00000421164 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
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AFG3L1P-204ENST00000421164 CCL15Q16663 113 aa20.25■□□□□ 0.83
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AFG3L1P-204ENST00000421164 ADGRF4Q8IZF3 695 aa20.25■□□□□ 0.83
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AFG3L1P-204ENST00000421164 PTPN18Q99952 460 aa20.25■□□□□ 0.83
AFG3L1P-204ENST00000421164 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
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AFG3L1P-204ENST00000421164 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
AFG3L1P-204ENST00000421164 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa20.24■□□□□ 0.83
AFG3L1P-204ENST00000421164 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
AFG3L1P-204ENST00000421164 CCDC102AQ96A19 550 aa20.24■□□□□ 0.83
AFG3L1P-204ENST00000421164 JMJD4Q9H9V9 463 aa20.24■□□□□ 0.83
AFG3L1P-204ENST00000421164 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa20.24■□□□□ 0.83
AFG3L1P-204ENST00000421164 PTPDC1A2A3K4 754 aa20.24■□□□□ 0.83
AFG3L1P-204ENST00000421164 FDPSP14324 419 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
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