RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416182.1

AF241725.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AF241725.1, Length 480 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AF241725.1-201ENST00000416182 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 RUFY4Q6ZNE9 571 aa4.96□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 TTLL10Q6ZVT0 673 aa4.96□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa4.96□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 TOX2Q96NM4 488 aa4.96□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 SLC9A7Q96T83 725 aa4.96□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 KIF2CQ99661 725 aa4.96□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 CTNND2Q9UQB3 1225 aa4.96□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 UBOX5O94941 541 aa4.95□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 TSPAN15O95858 294 aa4.95□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 EOMESO95936 686 aa4.95□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 ETV3P41162 512 aa4.95□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 ZP2Q05996 745 aa4.95□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa4.95□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 FAM214BQ7L5A3 538 aa4.95□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 TTC6Q86TZ1 520 aa4.95□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 CKAP2LQ8IYA6 745 aa4.95□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 COX4I2Q96KJ9 171 aa4.95□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 TNKS2Q9H2K2 1166 aa4.95□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 ACTR10Q9NZ32 417 aa4.95□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 CEP131Q9UPN4 1083 aa4.95□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa4.95□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 SLC12A7Q9Y666 1083 aa4.95□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 TMEM265A0A087WTH1 108 aa4.94□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 A0A1W2PQH9 124 aa4.94□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 KLF4O43474 513 aa4.94□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 GBP1P32455 592 aa4.94□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 RBL2Q08999 1139 aa4.94□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 IKZF1Q13422 519 aa4.94□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 NBPF6Q5VWK0 638 aa4.94□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 UNC5AQ6ZN44 842 aa4.94□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 ANKS3Q6ZW76 656 aa4.94□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 RIN3Q8TB24 985 aa4.94□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 NBPF4Q96M43 638 aa4.94□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP4.94□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 USP35Q9P2H5 1018 aa4.94□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 CLEC3AO75596 197 aa4.93□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 CYP7A1P22680 504 aa4.93□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 RNF4P78317 190 aa4.93□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 PPP2R5EQ16537 467 aa4.93□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 NKPD1Q17RQ9 610 aa4.93□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 C22orf34Q6ZV56 151 aa4.93□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 CDH24Q86UP0 819 aa4.93□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 ANKLE2Q86XL3 938 aa4.93□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 SPACA3Q8IXA5 215 aa4.93□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 TMEM192Q8IY95 271 aa4.93□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 RNF141Q8WVD5 230 aa4.93□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 DHRS1Q96LJ7 313 aa4.93□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 KREMEN1Q96MU8 473 aa4.93□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 SLC6A18Q96N87 628 aa4.93□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 ASPNQ9BXN1 380 aa4.93□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 C19orf73Q9NVV2 129 aa4.93□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa4.93□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 LTBP3Q9NS15 1303 aa4.93□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 FAM86C2PA6NEL3 165 aa4.92□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 NPIPB6E9PJ23 425 aa4.92□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP4.92□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 IGSF3O75054 1194 aa4.92□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 INHBBP09529 407 aa4.92□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 PMS1P54277 932 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 RAB33AQ14088 237 aa4.92□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 BBS9Q3SYG4 887 aa4.92□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 SFRP5Q5T4F7 317 aa4.92□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 SOGA3Q5TF21 947 aa4.92□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 DIRC2Q96SL1 478 aa4.92□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 MKNK2Q9HBH9 465 aa4.92□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 FAM53CQ9NYF3 392 aa4.92□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 KIR3DL1P43629 444 aa4.91□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 CHMP4BP1P59074 171 aa4.91□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 SERINC3Q13530 473 aa4.91□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 FXNQ16595 210 aa4.91□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 MPZL3Q6UWV2 235 aa4.91□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 PPFIBP1Q86W92 1011 aa4.91□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 SIAH1Q8IUQ4 282 aa4.91□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa4.91□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 VWCEQ96DN2 955 aa4.91□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 C20orf173Q96LM9 149 aa4.91□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 TRIM55Q9BYV6 548 aa4.91□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa4.91□□□□□ -1.62
AF241725.1-201ENST00000416182 GNAT3A8MTJ3 354 aa4.9□□□□□ -1.63
AF241725.1-201ENST00000416182 GLI1P08151 1106 aa4.9□□□□□ -1.63
AF241725.1-201ENST00000416182 NCAPHQ15003 741 aa4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms