RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.24■■□□□ 1.31
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UBXN4-202ENST00000415164 TRIM60Q495X7 471 aa23.23■■□□□ 1.31
UBXN4-202ENST00000415164 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
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UBXN4-202ENST00000415164 SLC25A27O95847 323 aa23.21■■□□□ 1.31
UBXN4-202ENST00000415164 SLC4A3P48751 1232 aa23.21■■□□□ 1.31
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UBXN4-202ENST00000415164 A0A0G2JMZ2 1700 aa23.21■■□□□ 1.31
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF236Q9UL36 1845 aa23.21■■□□□ 1.31
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UBXN4-202ENST00000415164 CTR9Q6PD62 1173 aa23.2■■□□□ 1.3
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UBXN4-202ENST00000415164 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
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UBXN4-202ENST00000415164 A0A0C4DFX4 3053 aa23.17■■□□□ 1.3
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UBXN4-202ENST00000415164 C9orf50Q5SZB4 431 aa23.17■■□□□ 1.3
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UBXN4-202ENST00000415164 GUCD1Q96NT3 240 aa23.17■■□□□ 1.3
UBXN4-202ENST00000415164 MKNK2Q9HBH9 465 aa23.17■■□□□ 1.3
UBXN4-202ENST00000415164 PDLIM7Q9NR12 457 aa23.17■■□□□ 1.3
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UBXN4-202ENST00000415164 RLFQ13129 1914 aa23.17■■□□□ 1.3
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UBXN4-202ENST00000415164 TLE2Q04725 743 aa23.15■■□□□ 1.3
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UBXN4-202ENST00000415164 ZNF792Q3KQV3 632 aa23.14■■□□□ 1.29
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UBXN4-202ENST00000415164 TSHZ3Q63HK5 1081 aa23.13■■□□□ 1.29
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UBXN4-202ENST00000415164 CPXCR1Q8N123 301 aa23.13■■□□□ 1.29
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UBXN4-202ENST00000415164 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.13■■□□□ 1.29
UBXN4-202ENST00000415164 NRBP1Q9UHY1 535 aa23.13■■□□□ 1.29
UBXN4-202ENST00000415164 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
UBXN4-202ENST00000415164 PHF24Q9UPV7 400 aa23.13■■□□□ 1.29
UBXN4-202ENST00000415164 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
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UBXN4-202ENST00000415164 AKR1A1P14550 325 aa23.12■■□□□ 1.29
UBXN4-202ENST00000415164 TDO2P48775 406 aa23.12■■□□□ 1.29
UBXN4-202ENST00000415164 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.12■■□□□ 1.29
UBXN4-202ENST00000415164 GPATCH3Q96I76 525 aa23.12■■□□□ 1.29
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UBXN4-202ENST00000415164 LTBP2Q14767 1821 aa23.11■■□□□ 1.29
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UBXN4-202ENST00000415164 RASA1P20936 1047 aa23.11■■□□□ 1.29
UBXN4-202ENST00000415164 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP23.11■■□□□ 1.29
UBXN4-202ENST00000415164 REPS2Q8NFH8 660 aa23.11■■□□□ 1.29
UBXN4-202ENST00000415164 KIFC2Q96AC6 838 aa23.11■■□□□ 1.29
UBXN4-202ENST00000415164 TEX13BQ9BXU2 312 aa23.11■■□□□ 1.29
UBXN4-202ENST00000415164 CLIP2Q9UDT6 1046 aa23.11■■□□□ 1.29
UBXN4-202ENST00000415164 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
UBXN4-202ENST00000415164 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
UBXN4-202ENST00000415164 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
UBXN4-202ENST00000415164 A0A1W2PQY0 241 aa23.1■■□□□ 1.29
UBXN4-202ENST00000415164 GSG1L2A8MUP6 293 aa23.1■■□□□ 1.29
UBXN4-202ENST00000415164 F5H6K3 240 aa23.1■■□□□ 1.29
UBXN4-202ENST00000415164 ZBED4O75132 1171 aa23.1■■□□□ 1.29
UBXN4-202ENST00000415164 PRDM1O75626 825 aa23.1■■□□□ 1.29
UBXN4-202ENST00000415164 NDUFB10O96000 172 aa23.1■■□□□ 1.29
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