RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000408117.2

U3.33-201, humanhuman

BASIC

Gene U3, Length 204 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3.33-201ENST00000408117 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 SH3D19Q5HYK7 790 aa10.16□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 CST9Q5W186 159 aa10.16□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 TMTC3Q6ZXV5 915 aa10.16□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 FAM160B2Q86V87 743 aa10.16□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 CLEC10AQ8IUN9 316 aa10.16□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 RGS22Q8NE09 1264 aa10.16□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa10.16□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 C12orf42Q96LP6 360 aa10.16□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 SPZ1Q9BXG8 430 aa10.16□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 MTMR7Q9Y216 660 aa10.16□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 STK36Q9NRP7 1315 aa10.15□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 DEXIO95424 95 aa10.15□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 SLC4A3P48751 1232 aa10.15□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 STAT2P52630 851 aa10.15□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 HUNKP57058 714 aa10.15□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 IKQ13123 557 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP10.15□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 MTMR2Q13614 643 aa10.15□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 NTRK3Q16288 839 aa10.15□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 BTNL9Q6UXG8 535 aa10.15□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 MOB2Q70IA6 237 aa10.15□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa10.15□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 OPTNQ96CV9 577 aa10.15□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 OTUD5Q96G74 571 aa10.15□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 HHIPL1Q96JK4 782 aa10.15□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 FEM1BQ9UK73 627 aa10.15□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 PNMA2Q9UL42 364 aa10.15□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 KCNH4Q9UQ05 1017 aa10.15□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa10.15□□□□□ -0.78
U3.33-201ENST00000408117 PTPDC1A2A3K4 754 aa10.14□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 TMEM88BA6NKF7 163 aa10.14□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 TMEM232C9JQI7 657 aa10.14□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 IRF6O14896 467 aa10.14□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 GJB2P29033 226 aa10.14□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 GTF2A2P52657 109 aa10.14□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP10.14□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 SNAPC2Q13487 334 aa10.14□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 TRIM29Q14134 588 aa10.14□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 SPICE1Q8N0Z3 855 aa10.14□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 STAG2Q8N3U4 1231 aa10.14□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 CCDC82Q8N4S0 544 aa10.14□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 CCDC102AQ96A19 550 aa10.14□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 CLMNQ96JQ2 1002 aa10.14□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 SLC26A6Q9BXS9 759 aa10.14□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 RIOX1Q9H6W3 641 aa10.14□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 GPCPD1Q9NPB8 672 aa10.14□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 EMILIN3Q9NT22 766 aa10.14□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 HOXC10Q9NYD6 342 aa10.14□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 V9GY48 417 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 USP17L15C9J2P7 530 aa10.13□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 USP17L13C9JLJ4 530 aa10.13□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 USP17L11C9JVI0 530 aa10.13□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 USP17L18D6R9N7 530 aa10.13□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 USP17L22D6RA61 530 aa10.13□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 USP17L17D6RBQ6 530 aa10.13□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 USP17L19D6RCP7 530 aa10.13□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 USP17L20D6RJB6 530 aa10.13□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 hCG_1984214I3L0E3 225 aa10.13□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 PLEKHA8P1O95397 391 aa10.13□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 CTDNEP1O95476 244 aa10.13□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 GOLGA8HP0CJ92 632 aa10.13□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 CETPP11597 493 aa10.13□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 HMGCS2P54868 508 aa10.13□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 INHBEP58166 350 aa10.13□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 NUCB2P80303 420 aa10.13□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 USP17L24Q0WX57 530 aa10.13□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 FUT2Q10981 343 aa10.13□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 FAM83BQ5T0W9 1011 aa10.13□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 SYDE2Q5VT97 1194 aa10.13□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 RGMBQ6NW40 437 aa10.13□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 KCTD1Q719H9 257 aa10.13□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 NBPF11Q86T75 865 aa10.13□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 SAPCD2Q86UD0 394 aa10.13□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
U3.33-201ENST00000408117 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms