RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397317.8

CLDN7-202, Transcript of claudin 7, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN7, Length 1,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7-202ENST00000397317 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.95■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 ERICH2A1L162 156 aa20.94■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 KRT32Q14532 448 aa20.94■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 TSGA10IPQ3SY00 556 aa20.94■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20.94■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 DCAF4Q8WV16 495 aa20.94■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 ABHD8Q96I13 439 aa20.94■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 PAGR1Q9BTK6 254 aa20.94■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 KAT14Q9H8E8 782 aa20.94■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 EFCC1Q9HA90 598 aa20.94■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 FEM1BQ9UK73 627 aa20.94■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.94■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 MCCP23508 829 aa20.93■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 FCGRTP55899 365 aa20.93■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 ERVK-9P63128 1117 aa20.93■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 ERVK-24P63145 666 aa20.93■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 SLF1Q9BQI6 1058 aa20.93■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 MTA3Q9BTC8 594 aa20.93■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.93■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa20.93■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 MCM5P33992 734 aa20.92■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 HSPA4P34932 840 aa20.92■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 PSMC4P43686 418 aa20.92■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 CCNA1P78396 465 aa20.92■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 OTOP1Q7RTM1 612 aa20.92■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 FBXO28Q9NVF7 368 aa20.92■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 TRIM17Q9Y577 477 aa20.92■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 STAT2P52630 851 aa20.91■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 SEC23AQ15436 765 aa20.91■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 POTEEQ6S8J3 1075 aa20.91■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 FAM160B2Q86V87 743 aa20.91■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 PNMA1Q8ND90 353 aa20.91■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 CHURC1Q8WUH1 139 aa20.91■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 KCNB2Q92953 911 aa20.91■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 ATG4CQ96DT6 458 aa20.91■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 TRIM47Q96LD4 638 aa20.91■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.91■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.91■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 RLFQ13129 1914 aa20.9■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 TMEM232C9JQI7 657 aa20.9■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 PLA2G6O60733 806 aa20.9■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 CNMDO75829 334 aa20.9■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 HOXD10P28358 340 aa20.9■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 PRMT2P55345 433 aa20.9■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 CCDC96Q2M329 555 aa20.9■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 RASEFQ8IZ41 740 aa20.9■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 NEK1Q96PY6 1258 aa20.9■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 BTBD7Q9P203 1132 aa20.9■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 MTMR7Q9Y216 660 aa20.9■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 A0A0G2JMZ2 1700 aa20.9■□□□□ 0.94
CLDN7-202ENST00000397317 VWA5AO00534 786 aa20.89■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 PRC1O43663 620 aa20.89■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 SNHG28P0DPA3 235 aa20.89■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 FDX1P10109 184 aa20.89■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 PDHBP11177 359 aa20.89■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 MAPK4P31152 587 aa20.89■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 ANTXR2P58335 489 aa20.89■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 WTAPQ15007 396 aa20.89■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 TMEM67Q5HYA8 995 aa20.89■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 KCTD1Q719H9 257 aa20.89■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 CHST3Q7LGC8 479 aa20.89■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 KIFC2Q96AC6 838 aa20.89■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 TMEM87BQ96K49 555 aa20.89■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 USP26Q9BXU7 913 aa20.89■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 PARP14Q460N5 1801 aa20.89■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 WDR19Q8NEZ3 1342 aa20.88■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 PEX10O60683 326 aa20.88■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 CTGFP29279 349 aa20.88■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 CAP1Q01518 475 aa20.88■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 Q3C1V9 767 aa20.88■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 COA7Q96BR5 231 aa20.88■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 SPATC1LQ9H0A9 340 aa20.88■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 ZBED4O75132 1171 aa20.87■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 ZNF543Q08ER8 600 aa20.87■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 TMTC2Q8N394 836 aa20.87■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa20.87■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.87■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 MCOLN1Q9GZU1 580 aa20.87■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 SRRDQ9UH36 339 aa20.87■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 SNX14Q9Y5W7 946 aa20.87■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 PLS1Q14651 629 aa20.86■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.86■□□□□ 0.93
CLDN7-202ENST00000397317 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms