RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383698.3

VGLL3-201, Transcript of vestigial like family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGLL3, Length 2,475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3-201ENST00000383698 RRAGBQ5VZM2 374 aa24.37■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 PDXDC2PQ6P474 469 aa24.37■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 USP17L1Q7RTZ2 530 aa24.37■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 CREBRFQ8IUR6 639 aa24.37■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 PNMA1Q8ND90 353 aa24.37■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.37■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 TM4SF1P30408 202 aa24.36■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 CASQ1P31415 396 aa24.36■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 KIF5BP33176 963 aa24.36■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 GRIK5Q16478 980 aa24.36■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 PPFIBP1Q86W92 1011 aa24.36■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 RPS6KA4O75676 772 aa24.36■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 SLC44A5Q8NCS7 719 aa24.36■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa24.36■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 A0A0U1RQJ8 604 aa24.35■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 TYW1BQ6NUM6 668 aa24.35■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 BLIDQ8IZY5 108 aa24.35■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 ATRIPQ8WXE1 791 aa24.35■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 UBXN4Q92575 508 aa24.35■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 TRAPPC10P48553 1259 aa24.34■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 CLCN6P51797 869 aa24.34■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 C12orf60Q5U649 245 aa24.34■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 PKNOX2Q96KN3 472 aa24.34■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 EPC1Q9H2F5 836 aa24.34■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.34■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 LDHBP07195 334 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 RAD9BQ6WBX8 426 aa24.34■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 C8orf37Q96NL8 207 aa24.34■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 LZTFL1Q9NQ48 299 aa24.34■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa24.34■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 TADA3O75528 432 aa24.33■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 CASP14P31944 242 aa24.33■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 RASGRP2Q7LDG7 609 aa24.33■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
VGLL3-201ENST00000383698 MAST2Q6P0Q8 1798 aa24.33■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa24.33■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 PP2D1A8MPX8 630 aa24.33■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 PBX1P40424 430 aa24.33■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 KRT222Q8N1A0 295 aa24.33■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 PANX2Q96RD6 677 aa24.33■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 IRS2Q9Y4H2 1338 aa24.32■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 NFIXQ14938 502 aa24.32■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 SLC35G1Q2M3R5 365 aa24.32■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 FILIP1LQ4L180 1135 aa24.32■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa24.32■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 PCDHA4Q9UN74 947 aa24.32■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 GDAQ9Y2T3 454 aa24.32■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 CALML3P27482 149 aa24.32■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 KRT31Q15323 416 aa24.32■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa24.32■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 C4orf32Q8N8J7 132 aa24.32■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 KIFC2Q96AC6 838 aa24.32■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 CTAGE1Q96RT6 745 aa24.32■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 PLIN2Q99541 437 aa24.32■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 VPS16Q9H269 839 aa24.32■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 MAD2L2Q9UI95 211 aa24.32■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 CCDC175P0C221 793 aa24.31■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 GOLGA8HP0CJ92 632 aa24.31■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 TSPY3P0CV98 308 aa24.31■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 TSPY8P0CW00 308 aa24.31■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 CPVLQ9H3G5 476 aa24.31■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 ST7Q9NRC1 585 aa24.31■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 STX8Q9UNK0 236 aa24.31■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 MFAP3LO75121 409 aa24.3■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 GYPCP04921 128 aa24.3■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 STAT6P42226 847 aa24.3■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa24.3■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 RASSF8Q8NHQ8 419 aa24.3■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 NELFBQ8WX92 580 aa24.3■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 TAB2Q9NYJ8 693 aa24.3■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 RPN1P04843 607 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 PAK1Q13153 545 aa24.3■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.3■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 DGKHQ86XP1 1220 aa24.3■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.3■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.3■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa24.29■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 N4BP3O15049 544 aa24.29■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 INF2Q27J81 1249 aa24.29■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 TMEM60Q9H2L4 133 aa24.29■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 CYTH3O43739 400 aa24.29■■□□□ 1.48
VGLL3-201ENST00000383698 GRM4Q14833 912 aa24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms