RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC1A4P43007 532 aa18.09■□□□□ 0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 SART3Q15020 963 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 NECTIN1Q15223 517 aa18.09■□□□□ 0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 CREB3L3Q68CJ9 461 aa18.09■□□□□ 0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 PAGR1Q9BTK6 254 aa18.09■□□□□ 0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 RBPJLQ9UBG7 517 aa18.09■□□□□ 0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 FEM1BQ9UK73 627 aa18.09■□□□□ 0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 MYH4Q9Y623 1939 aa18.08■□□□□ 0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 ERICH2A1L162 156 aa18.08■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC27A2O14975 620 aa18.08■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 BMP3P12645 472 aa18.08■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 OTOP1Q7RTM1 612 aa18.08■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 CHURC1Q8WUH1 139 aa18.08■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKS1AQ92625 1134 aa18.08■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 SLF1Q9BQI6 1058 aa18.08■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM47Q9BQJ4 181 aa18.08■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 MCCP23508 829 aa18.07■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 ERVK-9P63128 1117 aa18.07■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 ERVK-24P63145 666 aa18.07■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 KRT32Q14532 448 aa18.07■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 RCSD1Q6JBY9 416 aa18.07■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 DCAF4Q8WV16 495 aa18.07■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 COA7Q96BR5 231 aa18.07■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa18.07■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 KAT14Q9H8E8 782 aa18.07■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa18.07■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 TNKSO95271 1327 aa18.06■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 FDX1P10109 184 aa18.06■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 MAPK4P31152 587 aa18.06■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM160B2Q86V87 743 aa18.06■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM47Q96LD4 638 aa18.06■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 TXNRD2Q9NNW7 524 aa18.06■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 PLA2G6O60733 806 aa18.05■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 ZBED4O75132 1171 aa18.05■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC34A2O95436 690 aa18.05■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 MCM5P33992 734 aa18.05■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 STAT2P52630 851 aa18.05■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 IKQ13123 557 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC96Q2M329 555 aa18.05■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 ATG4CQ96DT6 458 aa18.05■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 MTA3Q9BTC8 594 aa18.05■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa18.05■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa18.05■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 MTMR7Q9Y216 660 aa18.05■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM232C9JQI7 657 aa18.04■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 VWA5AO00534 786 aa18.04■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 TSGA10IPQ3SY00 556 aa18.04■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 STOX1Q6ZVD7 989 aa18.04■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 CYB5R4Q7L1T6 521 aa18.04■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 PNMA1Q8ND90 353 aa18.04■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 FBXO28Q9NVF7 368 aa18.04■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 SRRDQ9UH36 339 aa18.04■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 PTPN22Q9Y2R2 807 aa18.04■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 COPB2P35606 906 aa18.03■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 PLS1Q14651 629 aa18.03■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 Q3C1V9 767 aa18.03■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 TMTC2Q8N394 836 aa18.03■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 NKX2-3Q8TAU0 364 aa18.03■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 KIFC2Q96AC6 838 aa18.03■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 SPATC1LQ9H0A9 340 aa18.03■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 BTBD7Q9P203 1132 aa18.03■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 TAF6LQ9Y6J9 622 aa18.03■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 CNMDO75829 334 aa18.02■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC25A27O95847 323 aa18.02■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 PDHBP11177 359 aa18.02■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 CTGFP29279 349 aa18.02■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 HSPA4P34932 840 aa18.02■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 WTAPQ15007 396 aa18.02■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 SEC23AQ15436 765 aa18.02■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM67Q5HYA8 995 aa18.02■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 POTEEQ6S8J3 1075 aa18.02■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 SHCBP1Q8NEM2 672 aa18.02■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 RAET1EQ8TD07 263 aa18.02■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM87BQ96K49 555 aa18.02■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 MROH8Q9H579 483 aa18.02■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa18.02■□□□□ 0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 PRC1O43663 620 aa18.01■□□□□ 0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 STAT3P40763 770 aa18.01■□□□□ 0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 WDR78Q5VTH9 848 aa18.01■□□□□ 0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 KCTD1Q719H9 257 aa18.01■□□□□ 0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 PLEKHH3Q7Z736 793 aa18.01■□□□□ 0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 SOCS4Q8WXH5 440 aa18.01■□□□□ 0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 NEK1Q96PY6 1258 aa18.01■□□□□ 0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms