RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379445.7

CTXN3-201, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,660 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-201ENST00000379445 FOCADQ5VW36 1801 aa8.47□□□□□ -1.05
CTXN3-201ENST00000379445 ATAD5Q96QE3 1844 aa8.47□□□□□ -1.05
CTXN3-201ENST00000379445 C19orf81C9J6K1 198 aa8.46□□□□□ -1.05
CTXN3-201ENST00000379445 USP17L10C9JJH3 530 aa8.46□□□□□ -1.05
CTXN3-201ENST00000379445 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
CTXN3-201ENST00000379445 TATDN1Q6P1N9 297 aa8.46□□□□□ -1.05
CTXN3-201ENST00000379445 RHPN1Q8TCX5 695 aa8.46□□□□□ -1.05
CTXN3-201ENST00000379445 EHD4Q9H223 541 aa8.46□□□□□ -1.05
CTXN3-201ENST00000379445 TXNRD2Q9NNW7 524 aa8.46□□□□□ -1.05
CTXN3-201ENST00000379445 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa8.46□□□□□ -1.05
CTXN3-201ENST00000379445 MGAMO43451 1857 aa8.46□□□□□ -1.05
CTXN3-201ENST00000379445 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
CTXN3-201ENST00000379445 PEX10O60683 326 aa8.46□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 GH2P01242 217 aa8.46□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 HERVK_113P62684 666 aa8.46□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 MAP3K12Q12852 859 aa8.46□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa8.46□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 SIRT2Q8IXJ6 389 aa8.46□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 C12orf42Q96LP6 360 aa8.46□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 DEFB118Q96PH6 123 aa8.46□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 TMUB1Q9BVT8 246 aa8.46□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 TRIM34Q9BYJ4 488 aa8.46□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 TMOD4Q9NZQ9 345 aa8.46□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 SERPINB13Q9UIV8 391 aa8.46□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 HMGCRP04035 888 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 CAPN2P17655 700 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 USP5P45974 858 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 TRIB2Q92519 343 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 WNT2BQ93097 391 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 KIF1BPQ96EK5 621 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 HTATIP2Q9BUP3 242 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 PRO3102Q9H379 93 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 RBPJLQ9UBG7 517 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 CEP290O15078 2479 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa8.44□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 GOLGA8CPA6NN73 597 aa8.44□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 RGS20O76081 388 aa8.44□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 PDE6AP16499 860 aa8.44□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 SHMT1P34896 483 aa8.44□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 PLCD1P51178 756 aa8.44□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 GABPAQ06546 454 aa8.44□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 TRIM32Q13049 653 aa8.44□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa8.44□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 USP17L2Q6R6M4 530 aa8.44□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 DPF3Q92784 378 aa8.44□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 PORCNQ9H237 461 aa8.44□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 DDX19BQ9UMR2 479 aa8.44□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 ERVK-9P63128 1117 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 ERVK-24P63145 666 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 Q3C1V9 767 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 TTC6Q86TZ1 520 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 SOCS4Q8WXH5 440 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 USP6NLQ92738 828 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 RPTORQ8N122 1335 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF532Q9HCE3 1301 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 GOLIM4O00461 696 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 HMMRO75330 724 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 CNMDO75829 334 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 TFRCP02786 760 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 VCAM1P19320 739 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 MAPK4P31152 587 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 GUCY1A2P33402 732 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 ABCB5Q2M3G0 1257 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 ANKLE1Q8NAG6 615 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 ACER1Q8TDN7 264 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 NBPF3Q9H094 633 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 PLXNB2O15031 1838 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 USP17L15C9J2P7 530 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 USP17L11C9JVI0 530 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 USP17L18D6R9N7 530 aa8.42□□□□□ -1.06
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