RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370818.7

GPC3-201, Transcript of glypican 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPC3, Length 2,568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3-201ENST00000370818 TRIM75PA6NK02 468 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 NLRP12P59046 1061 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 PNOCQ13519 176 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 CCDC186Q7Z3E2 898 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 BRMS1Q9HCU9 246 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 CYTH3O43739 400 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 BPIFA3Q9BQP9 254 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 TSPYL1Q9H0U9 437 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 NLRP5P59047 1200 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 USP49Q70CQ1 688 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 RASGRP2Q7LDG7 609 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 CREBRFQ8IUR6 639 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 CNNM3Q8NE01 707 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 CSRNP2Q9H175 543 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 ST7Q9NRC1 585 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 TYW1BQ6NUM6 668 aa14.6□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 FOXN1O15353 648 aa14.6□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 CYP2C19P33261 490 aa14.6□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 GABPAQ06546 454 aa14.6□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 ISM2Q6H9L7 571 aa14.6□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 TRERF1Q96PN7 1200 aa14.6□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 NOVP48745 357 aa14.59□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 GNAQP50148 359 aa14.59□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 PICALMQ13492 652 aa14.59□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 C2CD5Q86YS7 1000 aa14.59□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 CEP95Q96GE4 821 aa14.59□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 KCNQ5Q9NR82 932 aa14.59□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.59□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 MTMR7Q9Y216 660 aa14.59□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 CDC25BP30305 580 aa14.59□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 SCNN1DP51172 638 aa14.59□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 ZNF174Q15697 407 aa14.59□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 TTC38Q5R3I4 469 aa14.59□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa14.59□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 QSER1Q2KHR3 1735 aa14.58□□□□□ -0.07
GPC3-201ENST00000370818 GOLGA8HP0CJ92 632 aa14.58□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 NCAPHQ15003 741 aa14.58□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa14.58□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa14.58□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 SH3GLB2Q9NR46 395 aa14.58□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa14.58□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 FOCADQ5VW36 1801 aa14.58□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 DBNDD1Q9H9R9 158 aa14.58□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 CLIP2Q9UDT6 1046 aa14.58□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 SERTAD1Q9UHV2 236 aa14.58□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 MYH1P12882 1939 aa14.57□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 M0R2N6 131 aa14.57□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 BMP15O95972 392 aa14.57□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.57□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 PODNQ7Z5L7 613 aa14.57□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 DRC7Q8IY82 874 aa14.57□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 EPSTI1Q96J88 318 aa14.57□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 CPVLQ9H3G5 476 aa14.57□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 A0A087X0B3 334 aa14.57□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 KLRF2D3W0D1 207 aa14.57□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 BMP6P22004 513 aa14.57□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 CALML3P27482 149 aa14.57□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 TRAPPC10P48553 1259 aa14.57□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 PTGDRQ13258 359 aa14.57□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 CCDC144BQ3MJ40 725 aa14.57□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 CEP135Q66GS9 1140 aa14.57□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa14.57□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 HHIPL2Q6UWX4 724 aa14.57□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 BLIDQ8IZY5 108 aa14.57□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 PDILTQ8N807 584 aa14.57□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 FERMT2Q96AC1 680 aa14.57□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 USP40Q9NVE5 1235 aa14.57□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 PCDHA4Q9UN74 947 aa14.57□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 PLIN4Q96Q06 1357 aa14.56□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 H0YIN7 160 aa14.56□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 POSTNQ15063 836 aa14.56□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 STYK1Q6J9G0 422 aa14.56□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 USP17L2Q6R6M4 530 aa14.56□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 LZTS2Q9BRK4 669 aa14.56□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 ZNF446Q9NWS9 450 aa14.56□□□□□ -0.08
GPC3-201ENST00000370818 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms