RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369439.4

TMLHE-202, Transcript of trimethyllysine hydroxylase, epsilon, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMLHE, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHE-202ENST00000369439 GPAT2Q6NUI2 795 aa5.93□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa5.93□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 FAM83AQ86UY5 434 aa5.93□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 GLYCTKQ8IVS8 523 aa5.93□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 DEFB123Q8N688 67 aa5.93□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 VGLL2Q8N8G2 317 aa5.93□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 FAM151AQ8WW52 585 aa5.93□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 HOOK2Q96ED9 719 aa5.93□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 FAM161BQ96MY7 647 aa5.93□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 DCTN4Q9UJW0 460 aa5.93□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 KCNH4Q9UQ05 1017 aa5.93□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 V9GY48 417 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 DOCK2Q92608 1830 aa5.92□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 MGAMO43451 1857 aa5.92□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 ALPK3Q96L96 1907 aa5.92□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 LAMA3Q16787 3333 aa5.92□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 H3BRB1 525 aa5.92□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 ICMTO60725 284 aa5.92□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 ALDH1L1O75891 902 aa5.92□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 PDE8BO95263 885 aa5.92□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 LDHBP07195 334 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 BCRP11274 1271 aa5.92□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 PTPRAP18433 802 aa5.92□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 MAPK1P28482 360 aa5.92□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 ADORA1P30542 326 aa5.92□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 PTK2Q05397 1052 aa5.92□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 NAALADL2Q58DX5 795 aa5.92□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 TREML2Q5T2D2 321 aa5.92□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 TAS1R3Q7RTX0 852 aa5.92□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 SCYL3Q8IZE3 742 aa5.92□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 SIX5Q8N196 739 aa5.92□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 ARMC2Q8NEN0 867 aa5.92□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP5.92□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 PRO3102Q9H379 93 aa5.92□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 ABCF2Q9UG63 623 aa5.92□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 NOD1Q9Y239 953 aa5.92□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 IL16Q14005 1332 aa5.92□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 ABL1P00519 1130 aa5.91□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 F12P00748 615 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 CCNYL3P0C7X3 344 aa5.91□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 CYP2B6P20813 491 aa5.91□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 PHKA1P46020 1223 aa5.91□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 HMGCS2P54868 508 aa5.91□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 ATP2B3Q16720 1220 aa5.91□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 HHIPL2Q6UWX4 724 aa5.91□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa5.91□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 NECAB2Q7Z6G3 386 aa5.91□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 FAM9BQ8IZU0 186 aa5.91□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 PHTF2Q8N3S3 785 aa5.91□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 WDR66Q8TBY9 1149 aa5.91□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 COA7Q96BR5 231 aa5.91□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 NUDT12Q9BQG2 462 aa5.91□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 DOCK1Q14185 1865 aa5.9□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 EYA2O00167 538 aa5.9□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 CXCL11O14625 94 aa5.9□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 HMGCRP04035 888 aa5.9□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 FGFR2P21802 821 aa5.9□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 BTDP43251 543 aa5.9□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 RPIAP49247 311 aa5.9□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 SEC13P55735 322 aa5.9□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 FGD1P98174 961 aa5.9□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 FKBP1CQ5VVH2 108 aa5.9□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 PDXDC2PQ6P474 469 aa5.9□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 LPIN2Q92539 896 aa5.9□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 C11orf49Q9H6J7 331 aa5.9□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 ZNF112Q9UJU3 913 aa5.9□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa5.9□□□□□ -1.46
TMLHE-202ENST00000369439 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
TMLHE-202ENST00000369439 ATRNL1Q5VV63 1379 aa5.9□□□□□ -1.47
TMLHE-202ENST00000369439 DOCK3Q8IZD9 2030 aa5.89□□□□□ -1.47
TMLHE-202ENST00000369439 COL6A3P12111 3177 aa5.89□□□□□ -1.47
TMLHE-202ENST00000369439 PHF20L1A8MW92 1017 aa5.89□□□□□ -1.47
TMLHE-202ENST00000369439 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
TMLHE-202ENST00000369439 CLDN10P78369 228 aa5.89□□□□□ -1.47
TMLHE-202ENST00000369439 SPP2Q13103 211 aa5.89□□□□□ -1.47
TMLHE-202ENST00000369439 RASGRF1Q13972 1273 aa5.89□□□□□ -1.47
TMLHE-202ENST00000369439 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
TMLHE-202ENST00000369439 OCLNQ16625 522 aa5.89□□□□□ -1.47
TMLHE-202ENST00000369439 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
TMLHE-202ENST00000369439 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms