RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 MLECQ14165 292 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 FAM196AQ6ZSG2 479 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 USHBP1Q8N6Y0 703 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 GOLM1Q8NBJ4 401 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 LRRC3Q9BY71 257 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 KCNQ5Q9NR82 932 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 OR14I1A6ND48 311 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 NRDCO43847 1150 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 UBOX5O94941 541 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 HOXA5P20719 270 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 FAM160A1Q05DH4 1040 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM132EQ6IEE7 984 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 MAP6Q96JE9 813 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.246e-9■□□□□ 9.6
PTPRK-202ENST00000368205 CRTAC1Q9NQ79 661 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 ROBO2Q9HCK4 1378 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 SLC22A31A6NKX4 558 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 ITGAEP38570 1179 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 CHMP4BP1P59074 171 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF385BQ569K4 471 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 FBXO27Q8NI29 283 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 C20orf173Q96LM9 149 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 PARD6AQ9NPB6 346 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 ATE1O95260 518 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 EFEMP2O95967 443 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 RPL10P27635 214 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 NBPF9Q3BBW0 867 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 LINC00116Q8NCU8 138 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 TCTN2Q96GX1 697 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 MRS2Q9HD23 443 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 VTI1BQ9UEU0 232 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 KCTD3Q9Y597 815 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM82A0PJX8 343 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 MINDY4BA8MYZ0 360 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 RFXAPO00287 272 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 USP2O75604 605 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 RAG1P15918 1043 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 GALK1P51570 392 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 ARSHQ5FYA8 562 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 ADGRF1Q5T601 910 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 TCERG1LQ5VWI1 586 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 ERMP1Q7Z2K6 904 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 WAPLQ7Z5K2 1190 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM151BQ8IW70 566 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 SGPP1Q9BX95 441 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 FOXP3Q9BZS1 431 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 GMIPQ9P107 970 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 ZMYM5Q9UJ78 669 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 TCFL5Q9UL49 500 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 CDCP2Q5VXM1 449 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 FBXL19Q6PCT2 694 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 TMC3Q7Z5M5 1100 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 KCNC2Q96PR1 638 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 KBTBD4Q9NVX7 518 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-202ENST00000368205 GREM1O60565 184 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 CCNFP41002 786 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 SSPNQ14714 243 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 SLC14A2Q15849 920 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 BBS9Q3SYG4 887 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 CEP128Q6ZU80 1094 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 HHIPL1Q96JK4 782 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 SIGLEC10Q96LC7 697 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 TLR3O15455 904 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 PNLIPP16233 465 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 BMP7P18075 431 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 ERCC3P19447 782 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 YBX1P67809 324 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 OVOS1Q6IE37 1185 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 SIRT2Q8IXJ6 389 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 RELTQ969Z4 430 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 CNNM2Q9H8M5 875 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 EHMT1Q9H9B1 1298 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 BRMS1Q9HCU9 246 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 SIGLEC6O43699 453 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 ERVFRD-1P60508 538 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 SIRT5Q9NXA8 310 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 IRAK3Q9Y616 596 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 ABLIM1O14639 778 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRK-202ENST00000368205 TRIM13O60858 407 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.4 ms