RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000351097.9

USP25-203, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 2,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-203ENST00000351097 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa26.99■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 SLX4Q8IY92 1834 aa26.98■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 CDK8P49336 464 aa26.98■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 PODNQ7Z5L7 613 aa26.98■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 ZNF287Q9HBT7 754 aa26.98■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 CCDC178Q5BJE1 867 aa26.97■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 PNMA1Q8ND90 353 aa26.97■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 CNKSR1Q969H4 720 aa26.97■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 KCNQ5Q9NR82 932 aa26.97■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 VPS54Q9P1Q0 977 aa26.97■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 CBX1P83916 185 aa26.97■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 NR5A1Q13285 461 aa26.97■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 SPECC1Q5M775 1068 aa26.97■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 OXER1Q8TDS5 423 aa26.97■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 DPF2Q92785 391 aa26.97■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 SNED1Q8TER0 1413 aa26.96■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 CFAP100Q494V2 611 aa26.96■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 C7orf43Q8WVR3 580 aa26.96■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 FEZ1Q99689 392 aa26.96■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 CEP131Q9UPN4 1083 aa26.96■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 XBP1P17861 261 aa26.95■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 SCNN1DP51172 638 aa26.95■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 POSTNQ15063 836 aa26.95■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 PHF20Q9BVI0 1012 aa26.95■■□□□ 1.91
USP25-203ENST00000351097 FOXN1O15353 648 aa26.95■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 TUBB4AP04350 444 aa26.95■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 VSTM4Q8IW00 320 aa26.95■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 ERO1AQ96HE7 468 aa26.95■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 FANCLQ9NW38 375 aa26.95■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 FOCADQ5VW36 1801 aa26.95■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 MYH6P13533 1939 aa26.95■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 BMP6P22004 513 aa26.94■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 KIF5BP33176 963 aa26.94■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 GRIN1Q05586 938 aa26.94■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 PICALMQ13492 652 aa26.94■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa26.94■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 CCP110O43303 1012 aa26.94■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 NT5DC1Q5TFE4 455 aa26.94■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 HHIPL2Q6UWX4 724 aa26.94■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 MAN1B1Q9UKM7 699 aa26.94■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 STX8Q9UNK0 236 aa26.93■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 MYH1P12882 1939 aa26.93■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 SLU7O95391 586 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 TMEM47Q9BQJ4 181 aa26.92■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.92■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 NEDD1Q8NHV4 660 aa26.92■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 TEKT1Q969V4 418 aa26.92■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 USP40Q9NVE5 1235 aa26.92■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 SERTAD1Q9UHV2 236 aa26.92■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 DACH1Q9UI36 760 aa26.92■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 TOP1P11387 765 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 MLKLQ8NB16 471 aa26.91■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 TMX1Q9H3N1 280 aa26.91■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 SPDYE4A6NLX3 237 aa26.91■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 ECE2O60344 883 aa26.91■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 SARSP49591 514 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 GRM4Q14833 912 aa26.91■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 STRIP1Q5VSL9 837 aa26.91■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 KANK3Q6NY19 840 aa26.91■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 STAG2Q8N3U4 1231 aa26.91■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 SMARCE1Q969G3 411 aa26.91■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 CABP5Q9NP86 173 aa26.91■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.9■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa26.9■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 TRIML1Q8N9V2 468 aa26.9■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 L2HGDHQ9H9P8 463 aa26.9■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 MAD2L2Q9UI95 211 aa26.9■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 PRR29P0C7W0 189 aa26.9■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 KRT2P35908 639 aa26.9■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 BAG6P46379 1132 aa26.9■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 GABPAQ06546 454 aa26.9■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 NPY5RQ15761 445 aa26.9■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 DACT2Q5SW24 774 aa26.9■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 TMEM232C9JQI7 657 aa26.89■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 SCG2P13521 617 aa26.89■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 MORC3Q14149 939 aa26.89■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 SYT10Q6XYQ8 523 aa26.89■■□□□ 1.9
USP25-203ENST00000351097 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
USP25-203ENST00000351097 CRKP46108 304 aa26.88■■□□□ 1.89
USP25-203ENST00000351097 AOC3Q16853 763 aa26.88■■□□□ 1.89
USP25-203ENST00000351097 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
USP25-203ENST00000351097 ATP2B1P20020 1258 aa26.88■■□□□ 1.89
USP25-203ENST00000351097 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
USP25-203ENST00000351097 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
USP25-203ENST00000351097 KIAA0825Q8IV33 1275 aa26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms