RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342075.8

PMS1-201, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2

Gene PMS1, Length 3,012 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-201ENST00000342075 SNHG28P0DPA3 235 aa16.11■□□□□ 0.17
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PMS1-201ENST00000342075 VGLL4Q14135 290 aa16.11■□□□□ 0.17
PMS1-201ENST00000342075 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
PMS1-201ENST00000342075 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
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PMS1-201ENST00000342075 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa16.11■□□□□ 0.17
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PMS1-201ENST00000342075 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
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PMS1-201ENST00000342075 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa16.11■□□□□ 0.17
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PMS1-201ENST00000342075 MTMR2Q13614 643 aa16.11■□□□□ 0.17
PMS1-201ENST00000342075 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
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PMS1-201ENST00000342075 GMCL1Q96IK5 515 aa16.05■□□□□ 0.16
PMS1-201ENST00000342075 SPZ1Q9BXG8 430 aa16.05■□□□□ 0.16
PMS1-201ENST00000342075 RIOX1Q9H6W3 641 aa16.05■□□□□ 0.16
PMS1-201ENST00000342075 GOPCQ9HD26 462 aa16.05■□□□□ 0.16
PMS1-201ENST00000342075 CNPY2Q9Y2B0 182 aa16.05■□□□□ 0.16
PMS1-201ENST00000342075 PTPRFP10586 1907 aa16.05■□□□□ 0.16
PMS1-201ENST00000342075 BTBD18B2RXH4 712 aa16.05■□□□□ 0.16
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