RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 DEXIO95424 95 aa6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 GUCY1A2P33402 732 aa6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 TMEM179Q6ZVK1 233 aa6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 UBE2Q2LH0YL09 131 aa6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 PEX14O75381 377 aa6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 GUCY1B3Q02153 619 aa6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 RESTQ13127 1097 aa6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 FERMT3Q86UX7 667 aa6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 STAG2Q8N3U4 1231 aa6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 TEPSINQ96N21 525 aa6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 AIFM3Q96NN9 605 aa6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 GRIN3BO60391 1043 aa6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 JAG1P78504 1218 aa6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 MAP3K10Q02779 954 aa6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 RASGRP2Q7LDG7 609 aa6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 NYAP2Q9P242 653 aa6.98□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 GNAQP50148 359 aa6.97□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 SEPT2Q15019 361 aa6.97□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 MIGA2Q7L4E1 593 aa6.97□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 CEP120Q8N960 986 aa6.97□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa6.97□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 CABP5Q9NP86 173 aa6.97□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 USP17L5A8MUK1 530 aa6.97□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 KIF20AO95235 890 aa6.97□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 GH2P01242 217 aa6.97□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 EEF2P13639 858 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 ATP2B2Q01814 1243 aa6.97□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 TRIM29Q14134 588 aa6.97□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 PKN1Q16512 942 aa6.97□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 MKL1Q969V6 931 aa6.97□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 LZTS2Q9BRK4 669 aa6.97□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 DEFB129Q9H1M3 183 aa6.97□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 GJB4Q9NTQ9 266 aa6.97□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 V9GY48 417 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 GOLGA8HP0CJ92 632 aa6.97□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 PDHBP11177 359 aa6.97□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 ICA1Q05084 483 aa6.97□□□□□ -1.29
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CCR6-201ENST00000341935 TCHHQ07283 1943 aa6.97□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 SNHG28P0DPA3 235 aa6.96□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 DPY19L2Q6NUT2 758 aa6.96□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 USP17L2Q6R6M4 530 aa6.96□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.96□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 RNF217Q8TC41 542 aa6.96□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 CNPY2Q9Y2B0 182 aa6.96□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 DOCK1Q14185 1865 aa6.96□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa6.96□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 KLRF2D3W0D1 207 aa6.96□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 SOCS7O14512 581 aa6.96□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 ASPRV1Q53RT3 343 aa6.96□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 ATL2Q8NHH9 583 aa6.96□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa6.96□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 SCN4AP35499 1836 aa6.96□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.96□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 CAP2P40123 477 aa6.96□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 SLC35G1Q2M3R5 365 aa6.96□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 SPZ1Q9BXG8 430 aa6.96□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 LMBRD1Q9NUN5 540 aa6.96□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.96□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.96□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 WDR90Q96KV7 1748 aa6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 KIF28PB7ZC32 967 aa6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 MMP1P03956 469 aa6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 SMARCA1P28370 1054 aa6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 DMTNQ08495 405 aa6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 FAM173BQ6P4H8 233 aa6.95□□□□□ -1.3
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