RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.04■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.04■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 TNFRSF25Q93038 417 aa22.04■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 TNMDQ9H2S6 317 aa22.04■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 VEZTQ9HBM0 779 aa22.04■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 MYOZ2Q9NPC6 264 aa22.04■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 CNTNAP1P78357 1384 aa22.04■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 CALML3P27482 149 aa22.04■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 MMP14P50281 582 aa22.04■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.04■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.04■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 WNT10BO00744 389 aa22.03■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 MAP3K11Q16584 847 aa22.03■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.03■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.03■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.03■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 MKL1Q969V6 931 aa22.03■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 PANK2Q9BZ23 570 aa22.03■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.03■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 BARHL2Q9NY43 387 aa22.03■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 NYAP2Q9P242 653 aa22.03■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 GDF11O95390 407 aa22.02■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 PRELPP51888 382 aa22.02■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.02■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.02■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 SPON1Q9HCB6 807 aa22.02■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.02■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.02■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 A0A1B0GVL5 298 aa22.02■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 SHTN1A0MZ66 631 aa22.02■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 FAM205CA6NFA0 338 aa22.02■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 ATP2B1P20020 1258 aa22.02■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 ZNF543Q08ER8 600 aa22.02■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 SEPT2Q15019 361 aa22.02■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.02■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 FAM83AQ86UY5 434 aa22.02■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 UTRNP46939 3433 aa22.02■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 FZD9O00144 591 aa22.01■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 STXBP3O00186 592 aa22.01■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 CMA1P23946 247 aa22.01■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 HOMER1Q86YM7 354 aa22.01■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.01■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.01■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.01■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.01■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 NDUFA8P51970 172 aa22■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 BLIDQ8IZY5 108 aa22■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 PIGSQ96S52 555 aa22■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 MYH4Q9Y623 1939 aa22■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 KINO60870 393 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 ICA1Q05084 483 aa22■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 GALNT17Q6IS24 598 aa22■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 CKAP2LQ8IYA6 745 aa22■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 TRIM75PA6NK02 468 aa21.99■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 ADAMTS3O15072 1205 aa21.99■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 CUTAO60888 179 aa21.99■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 GH2P01242 217 aa21.99■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 JAG1P78504 1218 aa21.99■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa21.98■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 DPF2Q92785 391 aa21.98■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 CLIC6Q96NY7 704 aa21.98■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 GJA3Q9Y6H8 435 aa21.98■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 CTAGE5O15320 804 aa21.98■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 CCDC192P0DO97 292 aa21.98■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 CCDC96Q2M329 555 aa21.98■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 SHC4Q6S5L8 630 aa21.98■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 DAGLBQ8NCG7 672 aa21.98■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 RNF214Q8ND24 703 aa21.98■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 NAPAP54920 295 aa21.97■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 ZMYND12Q9H0C1 365 aa21.97■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 M0R2N6 131 aa21.96■■□□□ 1.11
UPP1-201ENST00000331803 TBC1D12O60347 775 aa21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.9 ms