RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331563.6

PKP3-201, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP3, Length 2,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-201ENST00000331563 PALLDQ8WX93 1383 aa20.38■□□□□ 0.85
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PKP3-201ENST00000331563 OTUD6BQ8N6M0 293 aa20.37■□□□□ 0.85
PKP3-201ENST00000331563 NCOA7Q8NI08 942 aa20.37■□□□□ 0.85
PKP3-201ENST00000331563 NRAPQ86VF7 1730 aa20.37■□□□□ 0.85
PKP3-201ENST00000331563 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
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PKP3-201ENST00000331563 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
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PKP3-201ENST00000331563 CYP26C1Q6V0L0 522 aa20.36■□□□□ 0.85
PKP3-201ENST00000331563 CTAGE1Q96RT6 745 aa20.36■□□□□ 0.85
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PKP3-201ENST00000331563 MYO1FO00160 1098 aa20.36■□□□□ 0.85
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PKP3-201ENST00000331563 ARHGAP25P42331 645 aa20.36■□□□□ 0.85
PKP3-201ENST00000331563 TEX11Q8IYF3 940 aa20.36■□□□□ 0.85
PKP3-201ENST00000331563 CCDC51Q96ER9 411 aa20.36■□□□□ 0.85
PKP3-201ENST00000331563 SLC24A3Q9HC58 644 aa20.36■□□□□ 0.85
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PKP3-201ENST00000331563 SAR1BQ9Y6B6 198 aa20.36■□□□□ 0.85
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PKP3-201ENST00000331563 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
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PKP3-201ENST00000331563 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
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PKP3-201ENST00000331563 AFMP43652 599 aa20.35■□□□□ 0.85
PKP3-201ENST00000331563 FMNL3Q8IVF7 1028 aa20.35■□□□□ 0.85
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PKP3-201ENST00000331563 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.35■□□□□ 0.85
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PKP3-201ENST00000331563 COBLO75128 1261 aa20.35■□□□□ 0.85
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PKP3-201ENST00000331563 CCDC24Q8N4L8 307 aa20.35■□□□□ 0.85
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PKP3-201ENST00000331563 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PKP3-201ENST00000331563 KANK3Q6NY19 840 aa20.32■□□□□ 0.84
PKP3-201ENST00000331563 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PKP3-201ENST00000331563 GPR108Q9NPR9 543 aa20.32■□□□□ 0.84
PKP3-201ENST00000331563 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PKP3-201ENST00000331563 ZEB2O60315 1214 aa20.31■□□□□ 0.84
PKP3-201ENST00000331563 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PKP3-201ENST00000331563 CCDC122Q5T0U0 273 aa20.31■□□□□ 0.84
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