RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
SPNS2-201ENST00000329078 NELFBQ8WX92 580 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS2-201ENST00000329078 H3BQF6 201 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS2-201ENST00000329078 SCG2P13521 617 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS2-201ENST00000329078 FAM193AP78312 1265 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS2-201ENST00000329078 DPYDQ12882 1025 aa22.41■■□□□ 1.18
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SPNS2-201ENST00000329078 SPATA1Q5VX52 437 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS2-201ENST00000329078 KRT9P35527 623 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS2-201ENST00000329078 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
SPNS2-201ENST00000329078 LETM2Q2VYF4 491 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS2-201ENST00000329078 TRIM47Q96LD4 638 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS2-201ENST00000329078 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SPNS2-201ENST00000329078 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SPNS2-201ENST00000329078 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS2-201ENST00000329078 TNS2Q63HR2 1409 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS2-201ENST00000329078 ENC1O14682 589 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS2-201ENST00000329078 TROAPQ12815 778 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS2-201ENST00000329078 LEKR1Q6ZMV7 388 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS2-201ENST00000329078 CAPZA3Q96KX2 299 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS2-201ENST00000329078 COL18A1P39060 1754 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS2-201ENST00000329078 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS2-201ENST00000329078 STX10O60499 249 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS2-201ENST00000329078 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
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SPNS2-201ENST00000329078 C8orf37Q96NL8 207 aa22.39■■□□□ 1.18
SPNS2-201ENST00000329078 PPARDQ03181 441 aa22.39■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 LONRF2Q1L5Z9 754 aa22.39■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.39■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 PNMA1Q8ND90 353 aa22.39■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 EFCAB8A8MWE9 144 aa22.38■■□□□ 1.17
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SPNS2-201ENST00000329078 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.38■■□□□ 1.17
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SPNS2-201ENST00000329078 MARCH6O60337 910 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 KRT31Q15323 416 aa22.37■■□□□ 1.17
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SPNS2-201ENST00000329078 ZNF384Q8TF68 577 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 FAM53CQ9NYF3 392 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 TRIM10Q9UDY6 481 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 FAM170AA1A519 330 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 SLC35F6Q8N357 371 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 HPS3Q969F9 1004 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 DCCP43146 1447 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 PAK1Q13153 545 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 FKBP15Q5T1M5 1219 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 UBE4AQ14139 1066 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 NR1I3Q14994 352 aa22.36■■□□□ 1.17
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SPNS2-201ENST00000329078 FAN1Q9Y2M0 1017 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 PICALMQ13492 652 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 NGLY1Q96IV0 654 aa22.36■■□□□ 1.17
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SPNS2-201ENST00000329078 ZNF18P17022 549 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 KIF5BP33176 963 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 TMEM139Q8IV31 216 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.35■■□□□ 1.17
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SPNS2-201ENST00000329078 KCNJ18B7U540 433 aa22.35■■□□□ 1.17
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SPNS2-201ENST00000329078 CHMP4BP1P59074 171 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 KCNJ12Q14500 433 aa22.35■■□□□ 1.17
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SPNS2-201ENST00000329078 BLIDQ8IZY5 108 aa22.35■■□□□ 1.17
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SPNS2-201ENST00000329078 CALM3P0DP25 149 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
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SPNS2-201ENST00000329078 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 PRCPP42785 496 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 KIAA1328Q86T90 577 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.33■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 ASIC1P78348 528 aa22.33■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SPNS2-201ENST00000329078 ADGRG1Q9Y653 693 aa22.33■■□□□ 1.17
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