RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 SENP2Q9HC62 589 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 CASZ1Q86V15 1759 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 DTNBO60941 627 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 DDAH1O94760 285 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 FDPSP14324 419 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 CDC27P30260 824 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 MMP14P50281 582 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT85P78386 507 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 PICALMQ13492 652 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM29Q14134 588 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 ATL3Q6DD88 541 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 CDC37L1Q7L3B6 337 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKS1AQ92625 1134 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 TAOK3Q9H2K8 898 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 KAT14Q9H8E8 782 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 SWAP70Q9UH65 585 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 LOC100996750A0A140TA64 210 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 YDJCA8MPS7 323 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 MBD3O95983 291 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 RXRAP19793 462 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 KIF5BP33176 963 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 KLHL40Q2TBA0 621 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 LCE2CQ5TA81 110 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 FERMT3Q86UX7 667 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 AGBL3Q8NEM8 1001 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 ALG1Q9BT22 464 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 MYL10Q9BUA6 226 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 TMOD2Q9NZR1 351 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 CFAP45Q9UL16 551 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 BCS1LQ9Y276 419 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 ROBO3Q96MS0 1386 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 RAD17O75943 681 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 XBP1P17861 261 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 TNIP1Q15025 636 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 NTRK3Q16288 839 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 CFAP100Q494V2 611 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 USP48Q86UV5 1035 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 NEDD1Q8NHV4 660 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM47Q96LD4 638 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 MAP3K14Q99558 947 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 IDI2Q9BXS1 227 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 SERPINB13Q9UIV8 391 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 SLX4Q8IY92 1834 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 LTBP1Q14766 1721 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 PSMD14O00487 310 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 PPFIA3O75145 1194 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 DEXIO95424 95 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 RASA1P20936 1047 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 GNAQP50148 359 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 TROAPQ12815 778 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 DLGAP5Q15398 846 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM87AQ8NBN3 555 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC17Q96LX7 622 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC26A6Q9BXS9 759 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM34Q9BYJ4 488 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 SPON1Q9HCB6 807 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 PI4KBQ9UBF8 816 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 STK36Q9NRP7 1315 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 SNED1Q8TER0 1413 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa11.71□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 NMT2O60551 498 aa11.71□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 ENTPD3O75355 529 aa11.71□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP11.71□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 CIAPIN1Q6FI81 312 aa11.71□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 BRAPQ7Z569 592 aa11.71□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 PHKBQ93100 1093 aa11.71□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 GMLQ99445 158 aa11.71□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 EHD4Q9H223 541 aa11.71□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 IL17RBQ9NRM6 502 aa11.71□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 STX8Q9UNK0 236 aa11.71□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 CNPY2Q9Y2B0 182 aa11.71□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 NID2Q14112 1375 aa11.71□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms