RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PDE4D-201ENST00000309641 SAGE1Q9NXZ1 904 aa10.68□□□□□ -0.7
PDE4D-201ENST00000309641 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa10.68□□□□□ -0.7
PDE4D-201ENST00000309641 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
PDE4D-201ENST00000309641 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
PDE4D-201ENST00000309641 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
PDE4D-201ENST00000309641 FLOT1O75955 427 aa10.67□□□□□ -0.7
PDE4D-201ENST00000309641 GOLGA8HP0CJ92 632 aa10.67□□□□□ -0.7
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PDE4D-201ENST00000309641 C17orf99Q6UX52 265 aa10.67□□□□□ -0.7
PDE4D-201ENST00000309641 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
PDE4D-201ENST00000309641 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa10.67□□□□□ -0.7
PDE4D-201ENST00000309641 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa10.67□□□□□ -0.7
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PDE4D-201ENST00000309641 CFHR5Q9BXR6 569 aa10.67□□□□□ -0.7
PDE4D-201ENST00000309641 KAT14Q9H8E8 782 aa10.67□□□□□ -0.7
PDE4D-201ENST00000309641 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa10.67□□□□□ -0.7
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PDE4D-201ENST00000309641 SLC16A2P36021 539 aa10.67□□□□□ -0.7
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PDE4D-201ENST00000309641 KRT32Q14532 448 aa10.67□□□□□ -0.7
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PDE4D-201ENST00000309641 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
PDE4D-201ENST00000309641 GMCL1Q96IK5 515 aa10.67□□□□□ -0.7
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PDE4D-201ENST00000309641 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
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PDE4D-201ENST00000309641 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa10.66□□□□□ -0.7
PDE4D-201ENST00000309641 PARP14Q460N5 1801 aa10.66□□□□□ -0.7
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM232C9JQI7 657 aa10.66□□□□□ -0.7
PDE4D-201ENST00000309641 CNMDO75829 334 aa10.66□□□□□ -0.7
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PDE4D-201ENST00000309641 BCRP11274 1271 aa10.66□□□□□ -0.7
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PDE4D-201ENST00000309641 CTGFP29279 349 aa10.66□□□□□ -0.7
PDE4D-201ENST00000309641 NT5C2P49902 561 aa10.66□□□□□ -0.7
PDE4D-201ENST00000309641 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP10.66□□□□□ -0.7
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PDE4D-201ENST00000309641 Q3C1V9 767 aa10.66□□□□□ -0.7
PDE4D-201ENST00000309641 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa10.66□□□□□ -0.7
PDE4D-201ENST00000309641 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa10.66□□□□□ -0.7
PDE4D-201ENST00000309641 STAG2Q8N3U4 1231 aa10.66□□□□□ -0.7
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PDE4D-201ENST00000309641 PAGR1Q9BTK6 254 aa10.66□□□□□ -0.7
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PDE4D-201ENST00000309641 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa10.66□□□□□ -0.7
PDE4D-201ENST00000309641 BTBD7Q9P203 1132 aa10.66□□□□□ -0.7
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PDE4D-201ENST00000309641 CCDC178Q5BJE1 867 aa10.65□□□□□ -0.7
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PDE4D-201ENST00000309641 KIFC2Q96AC6 838 aa10.65□□□□□ -0.7
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM87BQ96K49 555 aa10.65□□□□□ -0.7
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PDE4D-201ENST00000309641 SLC35G1Q2M3R5 365 aa10.65□□□□□ -0.71
PDE4D-201ENST00000309641 RUFY3Q7L099 469 aa10.65□□□□□ -0.71
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF654Q8IZM8 581 aa10.65□□□□□ -0.71
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PDE4D-201ENST00000309641 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
PDE4D-201ENST00000309641 PSMA5P28066 241 aa10.64□□□□□ -0.71
PDE4D-201ENST00000309641 LIFRP42702 1097 aa10.64□□□□□ -0.71
PDE4D-201ENST00000309641 SP3Q02447 781 aa10.64□□□□□ -0.71
PDE4D-201ENST00000309641 LBX2Q6XYB7 198 aa10.64□□□□□ -0.71
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PDE4D-201ENST00000309641 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa10.64□□□□□ -0.71
PDE4D-201ENST00000309641 CD99L2Q8TCZ2 262 aa10.64□□□□□ -0.71
PDE4D-201ENST00000309641 NUP133Q8WUM0 1156 aa10.64□□□□□ -0.71
PDE4D-201ENST00000309641 DCAF4Q8WV16 495 aa10.64□□□□□ -0.71
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PDE4D-201ENST00000309641 C22orf23Q9BZE7 217 aa10.64□□□□□ -0.71
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PDE4D-201ENST00000309641 HOXC10Q9NYD6 342 aa10.64□□□□□ -0.71
PDE4D-201ENST00000309641 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa10.64□□□□□ -0.71
PDE4D-201ENST00000309641 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
PDE4D-201ENST00000309641 VWA5AO00534 786 aa10.63□□□□□ -0.71
PDE4D-201ENST00000309641 STAT2P52630 851 aa10.63□□□□□ -0.71
PDE4D-201ENST00000309641 ANAPC15P60006 121 aa10.63□□□□□ -0.71
PDE4D-201ENST00000309641 APOBRQ0VD83 1088 aa10.63□□□□□ -0.71
PDE4D-201ENST00000309641 IKQ13123 557 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PDE4D-201ENST00000309641 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM132BQ14DG7 1078 aa10.63□□□□□ -0.71
PDE4D-201ENST00000309641 NFXL1Q6ZNB6 911 aa10.63□□□□□ -0.71
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