RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277198.6

C9orf3-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf3, Length 1,966 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-201ENST00000277198 PCP11498 1178 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 XBP1P17861 261 aa14.73□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 FANCBQ8NB91 859 aa14.73□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 SPATA20Q8TB22 786 aa14.73□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 MYL10Q9BUA6 226 aa14.73□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 FANCLQ9NW38 375 aa14.73□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa14.73□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 SPDYE4A6NLX3 237 aa14.73□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 BMP15O95972 392 aa14.73□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 SYT10Q6XYQ8 523 aa14.73□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.72□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 ZNF18P17022 549 aa14.72□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 MORC3Q14149 939 aa14.72□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 TNIP1Q15025 636 aa14.72□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 KMT5BQ4FZB7 885 aa14.72□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 ISM2Q6H9L7 571 aa14.72□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 MICALL2Q8IY33 904 aa14.72□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 ESR2Q92731 530 aa14.72□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 SMARCE1Q969G3 411 aa14.72□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 UBAC1Q9BSL1 405 aa14.72□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 FAM53CQ9NYF3 392 aa14.72□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 MAN1B1Q9UKM7 699 aa14.72□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 A0A1B0GUL6 1792 aa14.72□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 G3V3G9 751 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 STX10O60499 249 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 BMP6P22004 513 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 APLP1P51693 650 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 FAM193AP78312 1265 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 DCAF8Q5TAQ9 597 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 SAMD7Q7Z3H4 446 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 HOMER1Q86YM7 354 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 ZNF654Q8IZM8 581 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 LCORLQ8N3X6 602 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 DPF2Q92785 391 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 LEMD3Q9Y2U8 911 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-201ENST00000277198 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 GUCY1A2P33402 732 aa14.71□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 PPARAQ07869 468 aa14.71□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 DLK2Q6UY11 383 aa14.71□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 KRT222Q8N1A0 295 aa14.71□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 ANKRD2Q9GZV1 360 aa14.71□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 INCENPQ9NQS7 918 aa14.71□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 LRP2BPQ9P2M1 347 aa14.71□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 VIL1P09327 827 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 TPM1P09493 284 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 ELF2Q15723 593 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 TRAF5O00463 557 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 PRKAB2O43741 272 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 CALM1P0DP23 149 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 CALM2P0DP24 149 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 CALM3P0DP25 149 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 SEC23AQ15436 765 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 TRIM65Q6PJ69 517 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 TOMM22Q9NS69 142 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 KCNJ14Q9UNX9 436 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 JAG2Q9Y219 1238 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 PASKQ96RG2 1323 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 FGRP09769 529 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 BCAMP50895 628 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 PDE4BQ07343 736 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 TMEM139Q8IV31 216 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 REXO1L1PQ8IX06 675 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 FERMT2Q96AC1 680 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 SERTAD1Q9UHV2 236 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 DNAI1Q9UI46 699 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 TRIM75PA6NK02 468 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 UBE2Q2LH0YL09 131 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 PLCD1P51178 756 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-201ENST00000277198 CREBRFQ8IUR6 639 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms