RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264318.3

GABRA4-201, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha4 subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GABRA4, Length 11,973 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4-201ENST00000264318 L2HGDHQ9H9P8 463 aa10.64□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 KRT13P13646 458 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 NLRP2Q9NX02 1062 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 FAM135BQ49AJ0 1406 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 TRIM37O94972 964 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 KRT14P02533 472 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 ARHGAP45Q92619 1136 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 SEPT3Q9UH03 358 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 B4DLN1 442 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 SPAG7O75391 227 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 PIK3C2GO75747 1445 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 STAT2P52630 851 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 HAUS4Q9H6D7 363 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 TMEM110Q86TL2 294 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 PFKFB2O60825 505 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 CUL1Q13616 776 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 MTRQ99707 1265 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 GOLGA8CPA6NN73 597 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 TBKBP1A7MCY6 615 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 PDXDC1Q6P996 788 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 PANX2Q96RD6 677 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 SMARCA4P51532 1647 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 STK10O94804 968 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 CAPN1P07384 714 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 TNIP2Q8NFZ5 429 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 TMOD2Q9NZR1 351 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 POTEB3A0JP26 581 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 PKP1Q13835 747 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 USH1GQ495M9 461 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 POTEBQ6S5H4 581 aa10.63□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 TRIM47Q96LD4 638 aa10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 ITIH3Q06033 890 aa10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 TTC39AQ5SRH9 613 aa10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 TCP1P17987 556 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 IRAK1P51617 712 aa10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 PPP4R3AQ6IN85 833 aa10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 FERMT1Q9BQL6 677 aa10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 FUT8Q9BYC5 575 aa10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 SYCE1LA8MT33 242 aa10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 FESP07332 822 aa10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 DDR1Q08345 913 aa10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 ZWILCHQ9H900 591 aa10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 EEF2P13639 858 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 PARP2Q9UGN5 583 aa10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 C2CD2Q9Y426 696 aa10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 YEATS2Q9ULM3 1422 aa10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 ARHGAP42A6NI28 874 aa10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 PLXNC1O60486 1568 aa10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 STRNO43815 780 aa10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 ECE1P42892 770 aa10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 MSH2P43246 934 aa10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 KIFAP3Q92845 792 aa10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 CD2APQ9Y5K6 639 aa10.62□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 TRIM63Q969Q1 353 aa10.61□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 CYFIP2Q96F07 1278 aa10.61□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 ZRANB1Q9UGI0 708 aa10.61□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 RASGRF1Q13972 1273 aa10.61□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 NUDCD3Q8IVD9 361 aa10.61□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 USP19O94966 1318 aa10.61□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 SERPINB6P35237 376 aa10.61□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 SEPT8Q92599 483 aa10.61□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 ATP8B2P98198 1209 aa10.61□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 GUCY1B3Q02153 619 aa10.61□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 FLCNQ8NFG4 579 aa10.61□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 ECEL1O95672 775 aa10.61□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 IL9RQ01113 521 aa10.61□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 SPATA17Q96L03 361 aa10.61□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 HGSO14964 777 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 PPP1R37O75864 691 aa10.61□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 DCTN3O75935 186 aa10.61□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 STRN3Q13033 797 aa10.61□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa10.61□□□□□ -0.71
GABRA4-201ENST00000264318 PEX5LQ8IYB4 626 aa10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms