RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259467.8

PDCL-201, Transcript of phosducin like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL, Length 2,813 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL-201ENST00000259467 BMP15O95972 392 aa11.25□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 TUBB4AP04350 444 aa11.25□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 CEP135Q66GS9 1140 aa11.25□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 RCSD1Q6JBY9 416 aa11.25□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 IQCA1Q86XH1 822 aa11.25□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 VSTM4Q8IW00 320 aa11.25□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 CCDC112Q8NEF3 446 aa11.25□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 MED15Q96RN5 788 aa11.25□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 TOMM22Q9NS69 142 aa11.25□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 INTS13Q9NVM9 706 aa11.25□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 MYH1P12882 1939 aa11.25□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 COL4A5P29400 1685 aa11.25□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 F8W031 263 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 PPIP5K2O43314 1243 aa11.25□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 XBP1P17861 261 aa11.25□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 KRT2P35908 639 aa11.25□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 NUP133Q8WUM0 1156 aa11.25□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 DPF2Q92785 391 aa11.25□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 CSRNP2Q9H175 543 aa11.25□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 PRDX5P30044 214 aa11.24□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 GTF2IP78347 998 aa11.24□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 CCDC93Q567U6 631 aa11.24□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 TMC6Q7Z403 805 aa11.24□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 FERMT2Q96AC1 680 aa11.24□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 CABP5Q9NP86 173 aa11.24□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 SERTAD1Q9UHV2 236 aa11.24□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 SNED1Q8TER0 1413 aa11.24□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 TRIM75PA6NK02 468 aa11.24□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 PRR29P0C7W0 189 aa11.24□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 TRAPPC10P48553 1259 aa11.24□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 FAM193AP78312 1265 aa11.24□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa11.24□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 TMEM139Q8IV31 216 aa11.24□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 A0A087X0B3 334 aa11.23□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 FAM205CA6NFA0 338 aa11.23□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 YDJCA8MPS7 323 aa11.23□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 SMC2O95347 1197 aa11.23□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 PPP4CP60510 307 aa11.23□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 EVX2Q03828 476 aa11.23□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 PTPN14Q15678 1187 aa11.23□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 USP49Q70CQ1 688 aa11.23□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa11.23□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 FANCLQ9NW38 375 aa11.23□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 VPS54Q9P1Q0 977 aa11.23□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 V9GY48 417 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 G3V3G9 751 aa11.23□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 WNT7AO00755 349 aa11.23□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 RAD17O75943 681 aa11.23□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 UBASH3AP57075 661 aa11.23□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 SPECC1Q5M775 1068 aa11.23□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 DCAF8Q5TAQ9 597 aa11.23□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 FCHSD1Q86WN1 690 aa11.23□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 L2HGDHQ9H9P8 463 aa11.23□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 SCN9AQ15858 1988 aa11.23□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 CCDC66A2RUB6 948 aa11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 M0R2N6 131 aa11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 SLFN14P0C7P3 912 aa11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 ISM2Q6H9L7 571 aa11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 CCDC82Q8N4S0 544 aa11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 SH3GLB2Q9NR46 395 aa11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 DACH1Q9UI36 760 aa11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 ECE2O60344 883 aa11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 DIXDC1Q155Q3 683 aa11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 E2F4Q16254 413 aa11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 C12orf60Q5U649 245 aa11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 TMC4Q7Z404 712 aa11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 ZNF804AQ7Z570 1209 aa11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 DGKHQ86XP1 1220 aa11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 LARGE2Q8N3Y3 721 aa11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 PLCD1P51178 756 aa11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 DPYDQ12882 1025 aa11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 CUL4BQ13620 913 aa11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 CREBRFQ8IUR6 639 aa11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 CERS5Q8N5B7 392 aa11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 C4orf32Q8N8J7 132 aa11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 SMARCE1Q969G3 411 aa11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 PRDM1O75626 825 aa11.21□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 SCG2P13521 617 aa11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms