RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258100.8

SMYD5-201, Transcript of SMYD family member 5, humanhuman

TSL 5

Gene SMYD5, Length 786 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5-201ENST00000258100 GRIN2CQ14957 1233 aa20.57■□□□□ 0.88
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SMYD5-201ENST00000258100 TMEM179Q6ZVK1 233 aa20.57■□□□□ 0.88
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SMYD5-201ENST00000258100 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
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SMYD5-201ENST00000258100 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
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SMYD5-201ENST00000258100 MB21D1Q8N884 522 aa20.56■□□□□ 0.88
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SMYD5-201ENST00000258100 ADAMTS4O75173 837 aa20.54■□□□□ 0.88
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SMYD5-201ENST00000258100 TINF2Q9BSI4 451 aa20.54■□□□□ 0.88
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SMYD5-201ENST00000258100 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SMYD5-201ENST00000258100 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.52■□□□□ 0.88
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SMYD5-201ENST00000258100 C16orf59Q7L2K0 433 aa20.51■□□□□ 0.87
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SMYD5-201ENST00000258100 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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SMYD5-201ENST00000258100 USP17L21D6R901 530 aa20.48■□□□□ 0.87
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SMYD5-201ENST00000258100 BCL11AQ9H165 835 aa20.47■□□□□ 0.87
SMYD5-201ENST00000258100 ZNF576Q9H609 170 aa20.47■□□□□ 0.87
SMYD5-201ENST00000258100 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SMYD5-201ENST00000258100 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SMYD5-201ENST00000258100 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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SMYD5-201ENST00000258100 SIRT2Q8IXJ6 389 aa20.46■□□□□ 0.87
SMYD5-201ENST00000258100 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
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