RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253451.8

CCL25-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CCL25, Length 953 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL25-201ENST00000253451 NID2Q14112 1375 aa18.34■□□□□ 0.53
CCL25-201ENST00000253451 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa18.34■□□□□ 0.53
CCL25-201ENST00000253451 GOLGA8AA7E2F4 631 aa18.34■□□□□ 0.53
CCL25-201ENST00000253451 WDR46O15213 610 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
CCL25-201ENST00000253451 ZBTB43O43298 467 aa18.34■□□□□ 0.53
CCL25-201ENST00000253451 SNHG28P0DPA3 235 aa18.34■□□□□ 0.53
CCL25-201ENST00000253451 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
CCL25-201ENST00000253451 STK3Q13188 491 aa18.34■□□□□ 0.53
CCL25-201ENST00000253451 CCL15Q16663 113 aa18.34■□□□□ 0.53
CCL25-201ENST00000253451 TREML2Q5T2D2 321 aa18.34■□□□□ 0.53
CCL25-201ENST00000253451 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa18.34■□□□□ 0.53
CCL25-201ENST00000253451 KCTD1Q719H9 257 aa18.34■□□□□ 0.53
CCL25-201ENST00000253451 DCAF4Q8WV16 495 aa18.34■□□□□ 0.53
CCL25-201ENST00000253451 BRI3BPQ8WY22 251 aa18.34■□□□□ 0.53
CCL25-201ENST00000253451 LPAR1Q92633 364 aa18.34■□□□□ 0.53
CCL25-201ENST00000253451 ZIC5Q96T25 663 aa18.34■□□□□ 0.53
CCL25-201ENST00000253451 GOLGA8HP0CJ92 632 aa18.33■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 CETPP11597 493 aa18.33■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 SLC1A4P43007 532 aa18.33■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 ZNF543Q08ER8 600 aa18.33■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 ME3Q16798 604 aa18.33■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 GPCPD1Q9NPB8 672 aa18.33■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa18.33■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 RLFQ13129 1914 aa18.33■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 AOC2O75106 756 aa18.32■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 CALM1P0DP23 149 aa18.32■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 CALM2P0DP24 149 aa18.32■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 CALM3P0DP25 149 aa18.32■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 BMP3P12645 472 aa18.32■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP18.32■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 RCAN1P53805 252 aa18.32■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 RTN1Q16799 776 aa18.32■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 ASPRV1Q53RT3 343 aa18.32■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 TTBK2Q6IQ55 1244 aa18.32■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 STAG2Q8N3U4 1231 aa18.32■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 TANGO6Q9C0B7 1094 aa18.32■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 MAD2L2Q9UI95 211 aa18.32■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 PLEKHA8P1O95397 391 aa18.31■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 CDC27P30260 824 aa18.31■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 CCT2P78371 535 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 ST3GAL1Q11201 340 aa18.31■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 GPAT2Q6NUI2 795 aa18.31■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 NECAB1Q8N987 351 aa18.31■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 FANCBQ8NB91 859 aa18.31■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 IL27Q8NEV9 243 aa18.31■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 CPVLQ9H3G5 476 aa18.31■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 FBXO28Q9NVF7 368 aa18.31■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa18.31■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 A0A0G2JMZ2 1700 aa18.31■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 TMEM232C9JQI7 657 aa18.3■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 PFKFB2O60825 505 aa18.3■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 SLC35G1Q2M3R5 365 aa18.3■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 SNX21Q969T3 373 aa18.3■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 MAP3K14Q99558 947 aa18.3■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 PTPN18Q99952 460 aa18.3■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 BTBD19C9JJ37 291 aa18.29■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 KIF5BP33176 963 aa18.29■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 SLC16A2P36021 539 aa18.29■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 MCM2P49736 904 aa18.29■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 VEGFBP49765 207 aa18.29■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 SCRN1Q12765 414 aa18.29■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 NOGQ13253 232 aa18.29■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 TMTC3Q6ZXV5 915 aa18.29■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 FAM43AQ8N2R8 423 aa18.29■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 GTF3C6Q969F1 213 aa18.29■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 TMX3Q96JJ7 454 aa18.29■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 USP17L15C9J2P7 530 aa18.28■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 USP17L13C9JLJ4 530 aa18.28■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 USP17L11C9JVI0 530 aa18.28■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 KLRF2D3W0D1 207 aa18.28■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 USP17L18D6R9N7 530 aa18.28■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 USP17L22D6RA61 530 aa18.28■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 USP17L17D6RBQ6 530 aa18.28■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 USP17L19D6RCP7 530 aa18.28■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 USP17L20D6RJB6 530 aa18.28■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP18.28■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 DTNBO60941 627 aa18.28■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 ADD1P35611 737 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 USP17L24Q0WX57 530 aa18.28■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 IKQ13123 557 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 ANKRD23Q86SG2 305 aa18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms